基因页:rfng
概括?
基因 | 5986 |
象征 | rfng |
同义词 | - |
描述 | RFNG O羟基肽3β-N-乙酰葡萄糖氨基转移酶 |
参考 | MIM:602578|HGNC:HGNC:9974|Ensembl:ENSG00000169733|HPRD:09093|Vega:Otthumg00000178512 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17Q25 |
Pascal P值 | 0.045 |
主持人 | 小脑半球 小脑 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RFNG_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
top2b | 0.97 | 0.97 |
DHX57 | 0.96 | 0.96 |
ZNF292 | 0.96 | 0.97 |
ZNF84 | 0.96 | 0.97 |
CNOT2 | 0.96 | 0.95 |
DHX29 | 0.96 | 0.97 |
ZNF644 | 0.96 | 0.96 |
WDR3 | 0.95 | 0.96 |
SF3B1 | 0.95 | 0.96 |
SUPT16H | 0.95 | 0.96 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.92 |
HLA-F | -0.76 | -0.82 |
AIFM3 | -0.76 | -0.82 |
AF347015.27 | -0.75 | -0.89 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.92 |
AF347015.33 | -0.75 | -0.89 |
TSC22D4 | -0.74 | -0.83 |
FXYD1 | -0.74 | -0.90 |
ifi27 | -0.74 | -0.90 |
S100B | -0.74 | -0.84 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
GO:0016757 | 转移酶活性,转移糖基团 | IEA | - | |
GO:0033829 | O藻糖基肽3-β-N-乙酰葡萄糖氨基转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突(GO期限:5) | - |
去:0009887 | 器官形态发生 | nas | 10341080 | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0005576 | 细胞外区域 | nas | 10341080 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Notch信号通路 | 47 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Pre Notch表达和处理 | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Golgi中的Reactome Pre Notch处理 | 16 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Notch的Reactome信号传导 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bogni治疗与髓样白血病有关 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mayburd对L663536的回应 | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FLI1和DAX1的Garcia目标 | 57 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shin B细胞淋巴瘤簇2 | 30 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |