概括
基因 5986
象征 rfng
同义词 -
描述 RFNG O羟基肽3β-N-乙酰葡萄糖氨基转移酶
参考 MIM:602578|HGNC:HGNC:9974|Ensembl:ENSG00000169733|HPRD:09093|Vega:Otthumg00000178512
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q25
Pascal P值 0.045
主持人 小脑半球
小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
top2b 0.97 0.97
DHX57 0.96 0.96
ZNF292 0.96 0.97
ZNF84 0.96 0.97
CNOT2 0.96 0.95
DHX29 0.96 0.97
ZNF644 0.96 0.96
WDR3 0.95 0.96
SF3B1 0.95 0.96
SUPT16H 0.95 0.96
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.77 -0.92
HLA-F -0.76 -0.82
AIFM3 -0.76 -0.82
AF347015.27 -0.75 -0.89
MT-CO2 -0.75 -0.92
AF347015.33 -0.75 -0.89
TSC22D4 -0.74 -0.83
FXYD1 -0.74 -0.90
ifi27 -0.74 -0.90
S100B -0.74 -0.84

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003674 Molecular_Function nd -
GO:0016757 转移酶活性,转移糖基团 IEA -
GO:0033829 O藻糖基肽3-β-N-乙酰葡萄糖氨基转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007399 神经系统的发展 IEA 神经突(GO期限:5) -
去:0009887 器官形态发生 nas 10341080
去:0007275 多细胞生物发育 IEA -
去:0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005576 细胞外区域 nas 10341080
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Notch信号通路 47 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pre Notch表达和处理 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Golgi中的Reactome Pre Notch处理 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Notch的Reactome信号传导 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bogni治疗与髓样白血病有关 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mayburd对L663536的回应 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLI1和DAX1的Garcia目标 57 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shin B细胞淋巴瘤簇2 30 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由KRAS DN 120 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因