基因页：BCL2L2

概括?
基因ID 599
Symbol BCL2L2
同义词 bcl-w | bcl2-l-2 | bclw | ppp1r51
描述 BCL2 like 2
参考 MIM：601931|HGNC：HGNC：995|Ensembl:ENSG00000129473|HPRD:03569|Vega：Otthumg0000000028738
基因type protein-coding
地图位置 14q11.2-q12
Sherlock P值 0.198
度p-value 度:Sanders_2014:DS1_p=0.178:DS1_beta=0.004880:DS2_p=3.17e-05:DS2_beta=0.207:DS2_FDR=1.69e-03
Fetal beta -2.754

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
DEG：Sanders_2013 Microarray Whole-genome gene expression profiles using microarrays on lymphoblastoid cell lines (LCLs) from 413 cases and 446 controls.
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.047

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
BCAM 0.60 0.72
perp 0.59 0.68
ZFP36 0.59 0.49
SSH3 0.55 0.63
ICAM1 0.54 0.58
LASS1 0.54 0.61
SLCO4A1 0.52 0.57
FOXF1 0.50 0.51
APOLD1 0.49 0.36
MOBKL2C 0.49 0.56
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AKT3 -0.34 -0.45
ZNF33B -0.33 -0.45
PHF14 -0.33 -0.52
NLGN1 -0.33 -0.40
ROBO2 -0.32 -0.44
EPHA7 -0.32 -0.44
DOK6 -0.32 -0.41
ENY2 -0.32 -0.40
trdmt1 -0.32 -0.39
FANCM -0.32 -0.42

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005515 protein binding 新闻学会 15694340|16697956
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0007283 精子发生 塔斯 8761287
去：0006916 anti-apoptosis 塔斯 9500547
GO:0042981 regulation of apoptosis IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005737 细胞质 NAS -
GO:0005739 线粒体 IEA -
GO:0016020 膜 IEA -
GO:0031966 mitochondrial membrane IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
坏的 BBC2 |BCl2L8 BCL2-associated agonist of cell death - HPRD，Biogrid 11483855|12115603
坏的 BBC2 |BCl2L8 BCL2-associated agonist of cell death 坏与Bcl-w交互。 BIND 15694340
BAK1 BAK | BAK-LIKE | BCL2L7 | CDN1 | MGC117255 | MGC3887 BCL2-antagonist/killer 1 Affinity Capture-Western BioGRID 10381646
BAX BCL2L4 BCL2-associated X protein Affinity Capture-Western BioGRID 10381646
BBC3 JFY1 | PUMA BCL2 binding component 3 Puma interacts with Bcl-w. BIND 15694340
BCL2L11 BAM | BIM | BIM-alpha6 | BIM-beta6 | BIM-beta7 | BOD | BimEL | BimL BCL2-like 11 (apoptosis facilitator) BIM与Bcl-W相互作用。 BIND 15694340
BCL2L11 BAM | BIM | BIM-alpha6 | BIM-beta6 | BIM-beta7 | BOD | BimEL | BimL BCL2-like 11 (apoptosis facilitator) 两个杂交 BioGRID 9731710
BID FP497 | MGC15319 | MGC42355 BH3互动域死亡激动剂 Protein-peptide BioGRID 15694340
BID FP497 | MGC15319 | MGC42355 BH3互动域死亡激动剂 Bid interacts with Bcl-w. BIND 15694340
BIK Bip1 |BP4 |NBK BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing) Affinity Capture-Western BioGRID 10381646
BIK Bip1 |BP4 |NBK BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing) Bik interacts with Bcl-w. BIND 15694340
BMF FLJ00065 Bcl2 modifying factor Bmf interacts with Bcl-w. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between mouse Bmf and human Bcl-w. BIND 15694340
BMF FLJ00065 Bcl2 modifying factor - HPRD，Biogrid 11546872
HRK DP5 |哈拉基里 harakiri, BCL2 interacting protein (contains only BH3 domain) HRK与Bcl-W相互作用。 BIND 15694340
HRK DP5 |哈拉基里 harakiri, BCL2 interacting protein (contains only BH3 domain) Protein-peptide BioGRID 15694340
PMAIP1 APR | NOXA phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 Protein-peptide BioGRID 15694340
PPP1CA MGC15877 | MGC1674 | PP-1A | PPP1A protein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isoform Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 12115603


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
PID P53下游途径 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION DN 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND SERUM DEPRIVATION DN 84 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GALLUZZI PREVENT MITOCHONDIAL PERMEABILIZATION 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KREPPEL CD99 TARGETS DN 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TENEDINI MEGAKARYOCYTE MARKERS 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NATSUME RESPONSE TO INTERFERON BETA UP 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAYO AGING MUSCLE DN 123 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 88 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG DNA DAMAGE UP 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EHLERS ANEUPLOIDY UP 41 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk胚胎生殖细胞 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk男性繁殖Sertoli 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK SPERMATOCYTE 72 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK SPERMATID DIFFERENTIATION 37 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONCI TARGETS OF MIR15A AND MIR16 1 91 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Beier神经胶质瘤干细胞DN 66 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN MYELOMA VS MATURE B LYMPHOCYTE 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIKKELSEN ES ICP WITH H3K4ME3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 2ND EGF PULSE ONLY 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-10 1902 1908 1A HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU
mir-103/107 1364 1370 1A HSA-MIR-103脑 AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-122 1331 1337 1A hsa-miR-122a UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGU
mir-133 1544年 1551年 1A,m8 hsa-miR-133a UUGGUCCCCUUCAACCAGCUGU
hsa-miR-133b UUGGUCCCCUUCAACCAGCUA
mir-140 1954年 1960年 m8 hsa-miR-140脑 agugguuuuacccuaugguag
miR-148/152 1450 1456 1A hsa-miR-148a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa-miR-152脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa-miR-148b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
mir-149 1350 1357 1A,m8 hsa-miR-149脑 UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCC
mir-15/16/195/424/497 1390 1396 m8 hsa-miR-15a脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
hsa-miR-15b脑 uagcagcacaucaugguuaca
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
hsa-miR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
hsa-miR-15a脑 UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
hsa-miR-15b脑 uagcagcacaucaugguuaca
hsa-miR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
hsa-miR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 1599 1605 m8 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
hsa-miR-519d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
miR-214 1935年 1941年 1A HSA-MIR-214脑 ACAGCAGGCACAGACAGGCAG
mir-24 1348 1355 1A,m8 HSA-MIR-24SZ UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG
mir-29 1379 1385 1A hsa-miR-29aSZ uagcaccaucugaaaucgguu
hsa-miR-29bSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
hsa-miR-29cSZ UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
miR-30-3p 1938 1944年 1A hsa-miR-30a-3p cuuucagucggauguugcagc
hsa-miR-30e-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC