Gene Page:RGS4

概括?
基因 5999
象征 RGS4
Synonyms RGP4|SCZD9
Description regulator of G-protein signaling 4
Reference MIM：602516|HGNC:HGNC:10000|Ensembl:ENSG00000117152|HPRD:03947|Vega：Otthumg0000000034417
Gene type protein-coding
Map location 1q23.3
Sherlock p-value 0.938
Fetal beta -5.492
eGene Cerebellum
Myers' cis & trans
Support Potential synaptic genes

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV：GWASDB Genome-wide Association Studies GWASdb records for schizophrenia
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur High-throughput literature-search Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Association A combined odds ratio method (Sun et al. 2008），协会研究 3 Link to SZGene
GSMA_IIA Genome scan meta-analysis (All samples) Psr: 0.00814
文学 High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizotypy,schizophrenias,schizotypal 点击to show details
Network 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 31.0102

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs7132043 chr12 80968399 RGS4 5999 0.16 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

No co-expressed genes in brain regions


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0004871 signal transducer activity IEA -
GO:0005096 GTPase activator activity TAS 10747990
GO:0005516 calmodulin binding TAS 10747990
生物过程 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0000188 MAPK活动的失活 TAS 8602223
去：0009968 信号转导的负调节 IEA -
GO:0008277 regulation of G-protein coupled receptor protein signaling pathway TAS 10747990

V.途径注释

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
REACTOME SIGNALING BY GPCR 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GPCR DOWNSTREAM SIGNALING 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA I SIGNALLING EVENTS 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME G ALPHA Z SIGNALLING EVENTS 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERTUCCI MEDULLARY VS DUCTAL BREAST CANCER DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUIFFE INVASION INHIBITED BY ASCITES DN 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM SYSTOLIC HEART FAILURE UP 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CORRE MULTIPLE MYELOMA UP 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NEWMAN ERCC6 TARGETS DN 39 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS UP 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS 8HR UP 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS F UP 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN RESPONSE TO ARSENIC TRIOXIDE 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLOSSER SERUM RESPONSE DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 2 UP 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROZANOV MMP14 TARGETS UP 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD BMYB MORPHOLINO DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA TNF SIGNALING DN 90 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO HYPOXIA DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA RESPONSE TO IFNG DN 85 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HALMOS CEBPA TARGETS UP 52 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿布得生活信号1 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA PROX1 TARGETS DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN DN 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRASNOSELSKAYA ILF3 TARGETS UP 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 20HR DN 101 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE INCIPIENT DN 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOUGLAS BMI1 TARGETS UP 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE DN 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB DN 342 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POOLA INVASIVE BREAST CANCER UP 288 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村脂肪形成早期DN 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASSON RESPONSE TO GONADOTROPHINS DN 87 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASSON RESPONSE TO FORSKOLIN DN 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS CALB1 CORR UP 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
国外RB1目标成长G 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI NFIC TARGETS BASAL UP 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 SIGNALING VIA NFIC 1HR DN 106 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 SIGNALING VIA NFIC 10HR UP 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURAND STROMA S UP 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

mirna家族 Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-103/107 117 123 m8 HSA-MIR-103brain AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUGA
HSA-MIR-107brain AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA
mir-136 1539 1545年 m8 hsa-miR-136 ACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGGA
miR-26 1466 1473 1A,m8 hsa-miR-26abrain UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26bSZ uucaaguaauucaggauagguu
miR-31 1917 1923 m8 hsa-miR-31 AGGCAAGAUGCUGGCAUAGCUG