基因页:RHD
概括?
基因 | 6007 |
象征 | RHD |
同义词 | CD240D | DIIIC | RH30 | RHCED | RHDVA(TT)| RHDEL | RHPII | RHXIII | RH4 | RHDCW | RHII | RHII | RHK562-II | RHPI |
描述 | RH血液组D抗原 |
参考 | MIM:111680|HGNC:HGNC:10009|ENSEMBL:ENSG00000187010|HPRD:00199|Vega:Otthumg00000003476 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.11 |
Pascal P值 | 0.782 |
胎儿β | 0.516 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS55794721 | 1 | 25561667 | RHD | ENSG00000187010.14 | 8.219e-9 | 0 | -37217 | gtex_brain_ba24 |
RS72660908 | 1 | 25583610 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.053E-9 | 0 | -15274 | gtex_brain_ba24 |
RS9645452 | 1 | 25668326 | RHD | ENSG00000187010.14 | 3.824e-6 | 0 | 69442 | gtex_brain_ba24 |
RS3093584 | 1 | 25668714 | RHD | ENSG00000187010.14 | 3.852E-6 | 0 | 69830 | gtex_brain_ba24 |
RS3093614 | 1 | 25677844 | RHD | ENSG00000187010.14 | 4.276E-6 | 0 | 78960 | gtex_brain_ba24 |
RS630337 | 1 | 25724005 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.416E-7 | 0 | 125121 | gtex_brain_ba24 |
RS111941366 | 1 | 25736369 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.725E-6 | 0 | 137485 | gtex_brain_ba24 |
RS909832 | 1 | 25754025 | RHD | ENSG00000187010.14 | 6e-7 | 0 | 155141 | gtex_brain_ba24 |
RS71808843 | 1 | 25816658 | RHD | ENSG00000187010.14 | 9.934e-7 | 0 | 217774 | gtex_brain_ba24 |
RS72660960 | 1 | 25816847 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.089E-6 | 0 | 217963 | gtex_brain_ba24 |
RS72660961 | 1 | 25818452 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.089E-6 | 0 | 219568 | gtex_brain_ba24 |
RS55794721 | 1 | 25561667 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.877E-10 | 0 | -37217 | gtex_brain_putamen_basal |
RS72660908 | 1 | 25583610 | RHD | ENSG00000187010.14 | 3.2e-10 | 0 | -15274 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71652365 | 1 | 25610579 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.395E-6 | 0 | 11695 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3093578 | 1 | 25667911 | RHD | ENSG00000187010.14 | 3.226e-6 | 0 | 69027 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9645452 | 1 | 25668326 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.74E-6 | 0 | 69442 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3093583 | 1 | 25668366 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.651E-6 | 0 | 69482 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3093584 | 1 | 25668714 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.736E-6 | 0 | 69830 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3091242 | 1 | 25674785 | RHD | ENSG00000187010.14 | 3.269E-6 | 0 | 75901 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3091241 | 1 | 25674913 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.381E-6 | 0 | 76029 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3091240 | 1 | 25676935 | RHD | ENSG00000187010.14 | 3.231E-6 | 0 | 78051 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3093614 | 1 | 25677844 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.747E-6 | 0 | 78960 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3093632 | 1 | 25684012 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.903E-6 | 0 | 85128 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3093638 | 1 | 25685484 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.662E-6 | 0 | 86600 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1053438 | 1 | 25687901 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.522E-6 | 0 | 89017 | gtex_brain_putamen_basal |
RS599691 | 1 | 25698354 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.6e-6 | 0 | 99470 | gtex_brain_putamen_basal |
RS614997 | 1 | 25703776 | RHD | ENSG00000187010.14 | 9.701E-7 | 0 | 104892 | gtex_brain_putamen_basal |
RS646867 | 1 | 25709258 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.703E-6 | 0 | 110374 | gtex_brain_putamen_basal |
RS607116 | 1 | 25717841 | RHD | ENSG00000187010.14 | 9.332e-7 | 0 | 118957 | gtex_brain_putamen_basal |
RS665372 | 1 | 25719235 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.763E-6 | 0 | 120351 | gtex_brain_putamen_basal |
RS686631 | 1 | 25719599 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.761E-6 | 0 | 120715 | gtex_brain_putamen_basal |
RS679879 | 1 | 25720204 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.857E-6 | 0 | 121320 | gtex_brain_putamen_basal |
RS630337 | 1 | 25724005 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.359E-6 | 0 | 125121 | gtex_brain_putamen_basal |
RS631133 | 1 | 25724146 | RHD | ENSG00000187010.14 | 6.391E-7 | 0 | 125262 | gtex_brain_putamen_basal |
RS660129 | 1 | 25727438 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.073E-6 | 0 | 128554 | gtex_brain_putamen_basal |
RS706845 | 1 | 25730713 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.657E-6 | 0 | 131829 | gtex_brain_putamen_basal |
RS111941366 | 1 | 25736369 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.591E-9 | 0 | 137485 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12048617 | 1 | 25739064 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.273E-6 | 0 | 140180 | gtex_brain_putamen_basal |
RS28633797 | 1 | 25741629 | RHD | ENSG00000187010.14 | 8.089E-7 | 0 | 142745 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2982360 | 1 | 25745645 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.079E-6 | 0 | 146761 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2375313 | 1 | 25748235 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.353E-6 | 0 | 149351 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4649082 | 1 | 25748357 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.056E-6 | 0 | 149473 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4649084 | 1 | 25752617 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.025E-6 | 0 | 153733 | gtex_brain_putamen_basal |
RS909832 | 1 | 25754025 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.773E-10 | 0 | 155141 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11249249 | 1 | 25758134 | RHD | ENSG00000187010.14 | 3.071E-6 | 0 | 159250 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35497030 | 1 | 25783066 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.807E-6 | 0 | 184182 | gtex_brain_putamen_basal |
RS61775174 | 1 | 25787313 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.817E-6 | 0 | 188429 | gtex_brain_putamen_basal |
RS34054126 | 1 | 25792915 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.817E-6 | 0 | 194031 | gtex_brain_putamen_basal |
RS61775180 | 1 | 25793663 | RHD | ENSG00000187010.14 | 1.773E-6 | 0 | 194779 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35850196 | 1 | 25794892 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.817E-6 | 0 | 196008 | gtex_brain_putamen_basal |
RS67595476 | 1 | 25799681 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.728E-6 | 0 | 200797 | gtex_brain_putamen_basal |
RS61775184 | 1 | 25801409 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.819E-6 | 0 | 202525 | gtex_brain_putamen_basal |
RS66844552 | 1 | 25802056 | RHD | ENSG00000187010.14 | 3.254e-6 | 0 | 203172 | gtex_brain_putamen_basal |
RS71808843 | 1 | 25816658 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.876E-10 | 0 | 217774 | gtex_brain_putamen_basal |
RS72660960 | 1 | 25816847 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.843E-10 | 0 | 217963 | gtex_brain_putamen_basal |
RS72660961 | 1 | 25818452 | RHD | ENSG00000187010.14 | 2.843E-10 | 0 | 219568 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35495923 | 1 | 25851977 | RHD | ENSG00000187010.14 | 7.69e-8 | 0 | 253093 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RHD_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1QA | 0.87 | 0.84 |
C1QB | 0.86 | 0.84 |
C1QC | 0.83 | 0.81 |
tbxas1 | 0.82 | 0.82 |
adora3 | 0.81 | 0.79 |
C3AR1 | 0.80 | 0.76 |
SLC2A5 | 0.79 | 0.71 |
暴利 | 0.79 | 0.82 |
GPR34 | 0.79 | 0.79 |
fcer1g | 0.78 | 0.81 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SAFB2 | -0.43 | -0.46 |
UPF3A | -0.42 | -0.53 |
tnks1bp1 | -0.42 | -0.43 |
PABPN1 | -0.40 | -0.51 |
ZNF418 | -0.40 | -0.42 |
TAF15 | -0.40 | -0.44 |
axin1 | -0.39 | -0.40 |
ano8 | -0.39 | -0.45 |
vav2 | -0.39 | -0.41 |
RBM6 | -0.39 | -0.45 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003674 | Molecular_Function | nd | 1438298 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008150 | 生物_Process | nd | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | nas | 1438298 | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 1438298 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori小型BII淋巴细胞DN | 76 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1定位DN的Alcalay AML | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
营地结肠癌拷贝编号DN | 74 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集7 | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集8 | 26 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acosta增殖独立MYC目标DN | 116 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组D的UVC响应 | 280 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |