概括
基因 6007
象征 RHD
同义词 CD240D | DIIIC | RH30 | RHCED | RHDVA(TT)| RHDEL | RHPII | RHXIII | RH4 | RHDCW | RHII | RHII | RHK562-II | RHPI
描述 RH血液组D抗原
参考 MIM:111680|HGNC:HGNC:10009|ENSEMBL:ENSG00000187010|HPRD:00199|Vega:Otthumg00000003476
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.11
Pascal P值 0.782
胎儿β 0.516
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
下丘脑
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS55794721 1 25561667 RHD ENSG00000187010.14 8.219e-9 0 -37217 gtex_brain_ba24
RS72660908 1 25583610 RHD ENSG00000187010.14 1.053E-9 0 -15274 gtex_brain_ba24
RS9645452 1 25668326 RHD ENSG00000187010.14 3.824e-6 0 69442 gtex_brain_ba24
RS3093584 1 25668714 RHD ENSG00000187010.14 3.852E-6 0 69830 gtex_brain_ba24
RS3093614 1 25677844 RHD ENSG00000187010.14 4.276E-6 0 78960 gtex_brain_ba24
RS630337 1 25724005 RHD ENSG00000187010.14 2.416E-7 0 125121 gtex_brain_ba24
RS111941366 1 25736369 RHD ENSG00000187010.14 2.725E-6 0 137485 gtex_brain_ba24
RS909832 1 25754025 RHD ENSG00000187010.14 6e-7 0 155141 gtex_brain_ba24
RS71808843 1 25816658 RHD ENSG00000187010.14 9.934e-7 0 217774 gtex_brain_ba24
RS72660960 1 25816847 RHD ENSG00000187010.14 1.089E-6 0 217963 gtex_brain_ba24
RS72660961 1 25818452 RHD ENSG00000187010.14 1.089E-6 0 219568 gtex_brain_ba24
RS55794721 1 25561667 RHD ENSG00000187010.14 1.877E-10 0 -37217 gtex_brain_putamen_basal
RS72660908 1 25583610 RHD ENSG00000187010.14 3.2e-10 0 -15274 gtex_brain_putamen_basal
RS71652365 1 25610579 RHD ENSG00000187010.14 2.395E-6 0 11695 gtex_brain_putamen_basal
RS3093578 1 25667911 RHD ENSG00000187010.14 3.226e-6 0 69027 gtex_brain_putamen_basal
RS9645452 1 25668326 RHD ENSG00000187010.14 1.74E-6 0 69442 gtex_brain_putamen_basal
RS3093583 1 25668366 RHD ENSG00000187010.14 2.651E-6 0 69482 gtex_brain_putamen_basal
RS3093584 1 25668714 RHD ENSG00000187010.14 1.736E-6 0 69830 gtex_brain_putamen_basal
RS3091242 1 25674785 RHD ENSG00000187010.14 3.269E-6 0 75901 gtex_brain_putamen_basal
RS3091241 1 25674913 RHD ENSG00000187010.14 2.381E-6 0 76029 gtex_brain_putamen_basal
RS3091240 1 25676935 RHD ENSG00000187010.14 3.231E-6 0 78051 gtex_brain_putamen_basal
RS3093614 1 25677844 RHD ENSG00000187010.14 1.747E-6 0 78960 gtex_brain_putamen_basal
RS3093632 1 25684012 RHD ENSG00000187010.14 2.903E-6 0 85128 gtex_brain_putamen_basal
RS3093638 1 25685484 RHD ENSG00000187010.14 1.662E-6 0 86600 gtex_brain_putamen_basal
RS1053438 1 25687901 RHD ENSG00000187010.14 1.522E-6 0 89017 gtex_brain_putamen_basal
RS599691 1 25698354 RHD ENSG00000187010.14 1.6e-6 0 99470 gtex_brain_putamen_basal
RS614997 1 25703776 RHD ENSG00000187010.14 9.701E-7 0 104892 gtex_brain_putamen_basal
RS646867 1 25709258 RHD ENSG00000187010.14 1.703E-6 0 110374 gtex_brain_putamen_basal
RS607116 1 25717841 RHD ENSG00000187010.14 9.332e-7 0 118957 gtex_brain_putamen_basal
RS665372 1 25719235 RHD ENSG00000187010.14 1.763E-6 0 120351 gtex_brain_putamen_basal
RS686631 1 25719599 RHD ENSG00000187010.14 1.761E-6 0 120715 gtex_brain_putamen_basal
RS679879 1 25720204 RHD ENSG00000187010.14 2.857E-6 0 121320 gtex_brain_putamen_basal
RS630337 1 25724005 RHD ENSG00000187010.14 1.359E-6 0 125121 gtex_brain_putamen_basal
RS631133 1 25724146 RHD ENSG00000187010.14 6.391E-7 0 125262 gtex_brain_putamen_basal
RS660129 1 25727438 RHD ENSG00000187010.14 1.073E-6 0 128554 gtex_brain_putamen_basal
RS706845 1 25730713 RHD ENSG00000187010.14 1.657E-6 0 131829 gtex_brain_putamen_basal
RS111941366 1 25736369 RHD ENSG00000187010.14 2.591E-9 0 137485 gtex_brain_putamen_basal
RS12048617 1 25739064 RHD ENSG00000187010.14 1.273E-6 0 140180 gtex_brain_putamen_basal
RS28633797 1 25741629 RHD ENSG00000187010.14 8.089E-7 0 142745 gtex_brain_putamen_basal
RS2982360 1 25745645 RHD ENSG00000187010.14 1.079E-6 0 146761 gtex_brain_putamen_basal
RS2375313 1 25748235 RHD ENSG00000187010.14 1.353E-6 0 149351 gtex_brain_putamen_basal
RS4649082 1 25748357 RHD ENSG00000187010.14 1.056E-6 0 149473 gtex_brain_putamen_basal
RS4649084 1 25752617 RHD ENSG00000187010.14 1.025E-6 0 153733 gtex_brain_putamen_basal
RS909832 1 25754025 RHD ENSG00000187010.14 2.773E-10 0 155141 gtex_brain_putamen_basal
RS11249249 1 25758134 RHD ENSG00000187010.14 3.071E-6 0 159250 gtex_brain_putamen_basal
RS35497030 1 25783066 RHD ENSG00000187010.14 2.807E-6 0 184182 gtex_brain_putamen_basal
RS61775174 1 25787313 RHD ENSG00000187010.14 2.817E-6 0 188429 gtex_brain_putamen_basal
RS34054126 1 25792915 RHD ENSG00000187010.14 2.817E-6 0 194031 gtex_brain_putamen_basal
RS61775180 1 25793663 RHD ENSG00000187010.14 1.773E-6 0 194779 gtex_brain_putamen_basal
RS35850196 1 25794892 RHD ENSG00000187010.14 2.817E-6 0 196008 gtex_brain_putamen_basal
RS67595476 1 25799681 RHD ENSG00000187010.14 2.728E-6 0 200797 gtex_brain_putamen_basal
RS61775184 1 25801409 RHD ENSG00000187010.14 2.819E-6 0 202525 gtex_brain_putamen_basal
RS66844552 1 25802056 RHD ENSG00000187010.14 3.254e-6 0 203172 gtex_brain_putamen_basal
RS71808843 1 25816658 RHD ENSG00000187010.14 2.876E-10 0 217774 gtex_brain_putamen_basal
RS72660960 1 25816847 RHD ENSG00000187010.14 2.843E-10 0 217963 gtex_brain_putamen_basal
RS72660961 1 25818452 RHD ENSG00000187010.14 2.843E-10 0 219568 gtex_brain_putamen_basal
RS35495923 1 25851977 RHD ENSG00000187010.14 7.69e-8 0 253093 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1QA 0.87 0.84
C1QB 0.86 0.84
C1QC 0.83 0.81
tbxas1 0.82 0.82
adora3 0.81 0.79
C3AR1 0.80 0.76
SLC2A5 0.79 0.71
暴利 0.79 0.82
GPR34 0.79 0.79
fcer1g 0.78 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SAFB2 -0.43 -0.46
UPF3A -0.42 -0.53
tnks1bp1 -0.42 -0.43
PABPN1 -0.40 -0.51
ZNF418 -0.40 -0.42
TAF15 -0.40 -0.44
axin1 -0.39 -0.40
ano8 -0.39 -0.45
vav2 -0.39 -0.41
RBM6 -0.39 -0.45

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003674 Molecular_Function nd 1438298
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008150 生物_Process nd -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 nas 1438298
去:0005887 质膜的积分 塔斯 1438298

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
营地结肠癌拷贝编号DN 74 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集7 28 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集8 26 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC目标DN 116 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组D的UVC响应 280 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因