基因页:Rheb
Summary?
基因ID | 6009 |
Symbol | Rheb |
同义词 | RHEB2 |
描述 | 富含大脑的Ras同源物 |
参考 | MIM:601293|HGNC:HGNC:10011|ENSEMBL:ENSG00000106615|HPRD:03188|Vega:Otthumg00000157330 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q36 |
Pascal P值 | 0.023 |
胎儿β | -0.387 |
DMG | 1(#研究) |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14595269 | 7 | 151216272 | Rheb | 1.838E-4 | -0.227 | 0.034 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RHEB_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KIAA0494 | 0.83 | 0.84 |
夹子4 | 0.81 | 0.77 |
Nebl | 0.81 | 0.79 |
MAP3K5 | 0.81 | 0.81 |
DLG1 | 0.80 | 0.79 |
RNF6 | 0.80 | 0.76 |
ARAP2 | 0.80 | 0.82 |
投掷 | 0.79 | 0.80 |
ERMP1 | 0.79 | 0.83 |
Utrn | 0.79 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
BCL7C | -0.53 | -0.61 |
RPL35 | -0.51 | -0.61 |
RPL36 | -0.49 | -0.60 |
RPL28 | -0.49 | -0.60 |
SH2B2 | -0.48 | -0.46 |
RPL27 | -0.48 | -0.57 |
rps19p3 | -0.47 | -0.61 |
RPL18 | -0.47 | -0.60 |
TRAF4 | -0.47 | -0.50 |
RPLP1 | -0.46 | -0.56 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ATM | AT1 |ata |ATC |ATD |ATDC |吃饭|DKFZP781A0353 |MGC74674 |Tel1 |Telo1 | 毛细血管炎突变 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 15854902 |
ATM | AT1 |ata |ATC |ATD |ATDC |吃饭|DKFZP781A0353 |MGC74674 |Tel1 |Telo1 | 毛细血管炎突变 | ATM与RHEB相互作用。 | 绑定 | 15854902 |
Atr | frp1 |mec1 |sckl |SCKL1 | 共济失调的毛细血管扩张和RAD3相关 | ATR与Rheb相互作用。 | 绑定 | 15854902 |
Atr | frp1 |mec1 |sckl |SCKL1 | 共济失调的毛细血管扩张和RAD3相关 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 15854902 |
BCL2 | Bcl-2 | B细胞CLL/淋巴瘤2 | Bcl-2interacts with Rheb. | 绑定 | 9130713 |
FRAP1 | FLJ44809 |frap |frap2 |mtor |RAFT1 |Rapt1 | FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 | FRAP1(MTOR)与RHEB相互作用。 | 绑定 | 15854902 |
FRAP1 | FLJ44809 |frap |frap2 |mtor |RAFT1 |Rapt1 | FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 15772076|15854902 |15878852|16915281 |
gbl | LST8 |MGC111011 |pop3 |WAT1 | G蛋白β亚基样 | GBL(LST8)与Rheb相互作用。 | 绑定 | 15854902 |
hras | c-bas/has |C-H-Ras |C-HA-RAS1 |ctlo |H-Rasidx |hamsv |HRAS1 |k-ras |n-ras |Rash1 | V-HA-RAS HARVEY RAT SARMA病毒性癌基因同源物 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15854902 |
KIAA1303 | - | 猛禽 | 猛禽与Rheb互动。 | 绑定 | 15854902 |
KIAA1303 | - | 猛禽 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 15854902 |
PDE6D | PDED | 磷酸二酯酶6D,CGMP特异性,杆,三角洲 | - | HPRD,Biogrid | 11980706 |
Rab7a | FLJ20819 | PRO2706 | RAB7 | Rab7a,Ras Oncogene家族成员 | 共定位 | Biogrid | 15809346 |
Rab9a | Rab9 | Rab9a,Ras Oncogene家族成员 | 共定位 | Biogrid | 15809346 |
RAF1 | 克拉夫|NS5 |RAF-1 |C-Raf | V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1 | - | HPRD,Biogrid | 9001246 |
RAF1 | 克拉夫|NS5 |RAF-1 |C-Raf | V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1 | RAF与Rheb相互作用。 | 绑定 | 15854902 |
Rap1a | KREV-1 | KREV1 | RAP1 | SMGP21 | Rap1a,Ras Oncogene家族的成员 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15854902 |
TSC1 | KIAA0243 |林|MGC86987 |TSC | 结节硬化症1 | 生化活动 | Biogrid | 12820960 |
TSC2 | FLJ43106 | LAM | TSC4 | 结节硬化2 | - | HPRD,Biogrid | 12842888 |
TSC2 | FLJ43106 | LAM | TSC4 | 结节硬化2 | TSC2interacts with Rheb. | 绑定 | 15854902 |