总结吗?
GeneID 6014年
象征 RIT2
同义词 瑞芭| RIN | ROC2
描述 Ras-like没有CAAX 2
参考 MIM: 609592|HGNC: HGNC: 10017|运用:ENSG00000152214|HPRD: 15253|织女:OTTHUMG00000132611
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 18 q12.3
帕斯卡假定值 0.212
夏洛克假定值 0.542
胎儿β -1.173
eGene 前扣带皮层BA24

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs438012 18 39929420 RIT2 ENSG00000152214.8 3.477 e-6 0 766237年 gtex_brain_ba24
rs371357 18 39937973 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 757684年 gtex_brain_ba24
rs173199 18 39948111 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 747546年 gtex_brain_ba24
rs1156542 18 39953034 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 742623年 gtex_brain_ba24
rs1442648 18 39954248 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 741409年 gtex_brain_ba24
rs7238485 18 39955648 RIT2 ENSG00000152214.8 8.572 e - 0 740009年 gtex_brain_ba24
rs78272031 18 39956300 RIT2 ENSG00000152214.8 2.563 e-6 0 739357年 gtex_brain_ba24
rs1822264 18 39957067 RIT2 ENSG00000152214.8 8.572 e - 0 738590年 gtex_brain_ba24
rs1372762 18 39962759 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 732898年 gtex_brain_ba24
rs1372763 18 39962875 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 732782年 gtex_brain_ba24
rs28760399 18 39964365 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 731292年 gtex_brain_ba24
rs2165714 18 39965570 RIT2 ENSG00000152214.8 3.616 e - 0 730087年 gtex_brain_ba24
rs6507476 18 39968491 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 727166年 gtex_brain_ba24
rs9304271 18 39969314 RIT2 ENSG00000152214.8 3.616 e - 0 726343年 gtex_brain_ba24
rs398079414 18 39969448 RIT2 ENSG00000152214.8 1.281 e-6 0 726209年 gtex_brain_ba24
rs9304272 18 39970428 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 725229年 gtex_brain_ba24
rs61054461 18 39970791 RIT2 ENSG00000152214.8 4.513 e - 0 724866年 gtex_brain_ba24
rs7233924 18 39970828 RIT2 ENSG00000152214.8 8.542 e-8 0 724829年 gtex_brain_ba24
rs346271 18 39972779 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 722878年 gtex_brain_ba24
rs144588525 18 39973904 RIT2 ENSG00000152214.8 3.616 e - 0 721753年 gtex_brain_ba24
rs77013035 18 39973905 RIT2 ENSG00000152214.8 1.304 e-6 0 721752年 gtex_brain_ba24
rs180832 18 39974236 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 721421年 gtex_brain_ba24
rs189390 18 39974593 RIT2 ENSG00000152214.8 8.572 e - 0 721064年 gtex_brain_ba24
rs346242 18 39976421 RIT2 ENSG00000152214.8 2.142 e-6 0 719236年 gtex_brain_ba24
rs6146282 18 39977236 RIT2 ENSG00000152214.8 3.392 e - 0 718421年 gtex_brain_ba24
rs346244 18 39977576 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 718081年 gtex_brain_ba24
rs346245 18 39977967 RIT2 ENSG00000152214.8 8.572 e - 0 717690年 gtex_brain_ba24
rs346246 18 39978690 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 716967年 gtex_brain_ba24
rs445617 18 39979396 RIT2 ENSG00000152214.8 8.572 e - 0 716261年 gtex_brain_ba24
rs346247 18 39981520 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 714137年 gtex_brain_ba24
rs346248 18 39981791 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 713866年 gtex_brain_ba24
rs346249 18 39982232 RIT2 ENSG00000152214.8 3.616 e - 0 713425年 gtex_brain_ba24
rs346251 18 39985171 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 710486年 gtex_brain_ba24
rs346252 18 39986589 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 709068年 gtex_brain_ba24
rs346253 18 39986664 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 708993年 gtex_brain_ba24
rs346254 18 39986724 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 708933年 gtex_brain_ba24
rs346255 18 39987217 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 708440年 gtex_brain_ba24
rs346256 18 39987515 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 708142年 gtex_brain_ba24
rs346257 18 39987876 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 707781年 gtex_brain_ba24
rs346258 18 39988049 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 707608年 gtex_brain_ba24
rs346259 18 39988232 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 707425年 gtex_brain_ba24
rs346260 18 39988367 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 707290年 gtex_brain_ba24
rs346261 18 39988884 RIT2 ENSG00000152214.8 2.88 e-6 0 706773年 gtex_brain_ba24
rs71174099 18 39988962 RIT2 ENSG00000152214.8 2.797 e-6 0 706695年 gtex_brain_ba24
rs346263 18 39989221 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 706436年 gtex_brain_ba24
rs346264 18 39989228 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 706429年 gtex_brain_ba24
rs346265 18 39989431 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 706226年 gtex_brain_ba24
rs189389 18 39990442 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 705215年 gtex_brain_ba24
rs445364 18 39991820 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 703837年 gtex_brain_ba24
rs346266 18 39992444 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 703213年 gtex_brain_ba24
rs346267 18 39992969 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 702688年 gtex_brain_ba24
rs346268 18 39993094 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 702563年 gtex_brain_ba24
rs346269 18 39993389 RIT2 ENSG00000152214.8 3.616 e - 0 702268年 gtex_brain_ba24
rs451642 18 39993631 RIT2 ENSG00000152214.8 2.701 e-6 0 702026年 gtex_brain_ba24
rs346270 18 39993663 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 701994年 gtex_brain_ba24
rs180830 18 39993924 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 701733年 gtex_brain_ba24
rs180831 18 39994772 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 700885年 gtex_brain_ba24
rs173196 18 39995744 RIT2 ENSG00000152214.8 3.616 e - 0 699913年 gtex_brain_ba24
rs2584798 18 39996101 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 699556年 gtex_brain_ba24
rs675137 18 39996712 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 698945年 gtex_brain_ba24
rs417913 18 39997582 RIT2 ENSG00000152214.8 1.281 e-6 0 698075年 gtex_brain_ba24
rs410555 18 39997911 RIT2 ENSG00000152214.8 2.361 e-6 0 697746年 gtex_brain_ba24
rs437823 18 39998037 RIT2 ENSG00000152214.8 1.281 e-6 0 697620年 gtex_brain_ba24
rs397814049 18 39998578 RIT2 ENSG00000152214.8 1.241 e-6 0 697079年 gtex_brain_ba24
rs2567734 18 39999207 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 696450年 gtex_brain_ba24
rs346179 18 40000484 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 695173年 gtex_brain_ba24
rs173195 18 40000500 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 695157年 gtex_brain_ba24
rs346178 18 40000852 RIT2 ENSG00000152214.8 3.665 e - 0 694805年 gtex_brain_ba24
rs2567730 18 40003693 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 691964年 gtex_brain_ba24
rs2567729 18 40003812 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 691845年 gtex_brain_ba24
rs346181 18 40008452 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 687205年 gtex_brain_ba24
rs346180 18 40008628 RIT2 ENSG00000152214.8 1.281 e-6 0 687029年 gtex_brain_ba24
rs346199 18 40009943 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 685714年 gtex_brain_ba24
rs346200 18 40011018 RIT2 ENSG00000152214.8 1.281 e-6 0 684639年 gtex_brain_ba24
rs346201 18 40011957 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 683700年 gtex_brain_ba24
rs346202 18 40012078 RIT2 ENSG00000152214.8 1.281 e-6 0 683579年 gtex_brain_ba24
rs346204 18 40013669 RIT2 ENSG00000152214.8 1.281 e-6 0 681988年 gtex_brain_ba24
rs346206 18 40013858 RIT2 ENSG00000152214.8 1.281 e-6 0 681799年 gtex_brain_ba24
rs346208 18 40014493 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 681164年 gtex_brain_ba24
rs171119 18 40014887 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 680770年 gtex_brain_ba24
rs184925 18 40015179 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 680478年 gtex_brain_ba24
rs346209 18 40016600 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 679057年 gtex_brain_ba24
rs346212 18 40017917 RIT2 ENSG00000152214.8 8.572 e - 0 677740年 gtex_brain_ba24
rs346213 18 40018447 RIT2 ENSG00000152214.8 8.572 e - 0 677210年 gtex_brain_ba24
rs346214 18 40018754 RIT2 ENSG00000152214.8 2.733 e-6 0 676903年 gtex_brain_ba24
rs346218 18 40022060 RIT2 ENSG00000152214.8 1.038 e-6 0 673597年 gtex_brain_ba24
rs346222 18 40024675 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 670982年 gtex_brain_ba24
rs346223 18 40024947 RIT2 ENSG00000152214.8 8.572 e - 0 670710年 gtex_brain_ba24
rs5824428 18 40026912 RIT2 ENSG00000152214.8 3.6 e-6 0 668745年 gtex_brain_ba24
rs346224 18 40028311 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 667346年 gtex_brain_ba24
rs346225 18 40028359 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 667298年 gtex_brain_ba24
rs57552626 18 40030718 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 664939年 gtex_brain_ba24
rs1431834 18 40030890 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 664767年 gtex_brain_ba24
rs346182 18 40031333 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 664324年 gtex_brain_ba24
rs346183 18 40031488 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 664169年 gtex_brain_ba24
rs237970 18 40031936 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 663721年 gtex_brain_ba24
rs346184 18 40032691 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 662966年 gtex_brain_ba24
rs168300 18 40032866 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 662791年 gtex_brain_ba24
rs346185 18 40033310 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 662347年 gtex_brain_ba24
rs346186 18 40033369 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 662288年 gtex_brain_ba24
rs346187 18 40034530 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 661127年 gtex_brain_ba24
rs346188 18 40035147 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 660510年 gtex_brain_ba24
rs346189 18 40035275 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 660382年 gtex_brain_ba24
rs346190 18 40035793 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 659864年 gtex_brain_ba24
rs346191 18 40035917 RIT2 ENSG00000152214.8 2.756 e-6 0 659740年 gtex_brain_ba24
rs346192 18 40036138 RIT2 ENSG00000152214.8 2.796 e-6 0 659519年 gtex_brain_ba24
rs375614966 18 40036171 RIT2 ENSG00000152214.8 2.774 e-6 0 659486年 gtex_brain_ba24
rs971293 18 40036223 RIT2 ENSG00000152214.8 2.828 e-6 0 659434年 gtex_brain_ba24
rs400064 18 40036313 RIT2 ENSG00000152214.8 2.931 e-6 0 659344年 gtex_brain_ba24
rs346193 18 40037280 RIT2 ENSG00000152214.8 2.151 e-6 0 658377年 gtex_brain_ba24
rs346194 18 40037616 RIT2 ENSG00000152214.8 5.213 e-9 0 658041年 gtex_brain_ba24
rs72893569 18 40092256 RIT2 ENSG00000152214.8 3.347 e-6 0 603401年 gtex_brain_ba24

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
RNASEN 0.92 0.92
WDR5 0.92 0.93
SFRS14 0.92 0.93
PRCC 0.92 0.92
TACC2 0.92 0.94
UBAP2L 0.91 0.92
LSM14B 0.91 0.93
MSL1 0.91 0.92
SETD5 0.91 0.93
TOPBP1 0.91 0.92
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.86 -0.89
MT-CO2 -0.85 -0.88
AF347015.33 -0.82 -0.85
AF347015.27 -0.82 -0.86
MT-CYB -0.82 -0.85
AF347015.8 -0.81 -0.87
HIGD1B -0.80 -0.86
AF347015.21 -0.79 -0.89
AF347015.2 -0.79 -0.86
FXYD1 -0.79 -0.84

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000166 核苷酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0003924 GTPase活性 NAS 8824319
去:0005516 钙调蛋白结合 助教 8824319
去:0005525 三磷酸鸟苷结合 助教 8824319
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007268 突触传递 助教 Synap神经元,神经递质(术语层面:6) 8918462
去:0007165 信号转导 助教 8918462
去:0007264 小GTPase介导信号转导 经验值 10712923
去:0007264 小GTPase介导信号转导 NAS 8824319
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005622 细胞内的 国际能源机构 - - - - - -
去:0005886 等离子体膜 助教 8824319

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
PID TRKR通路 62年 48 所有SZGR 2.0基因通路
PID MAPK TRK通路 34 31日 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过神经生长因子 217年 167年 所有SZGR 2.0基因通路
从质膜通过TRKA REACTOME神经生长因子信号 137年 105年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME对erk信号 36 30. 所有SZGR 2.0基因通路
P38通过放射免疫和RIN REACTOME信号 15 14 所有SZGR 2.0基因通路
SILIGAN受EWS FLT1融合 47 34 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病DN布莱洛克的 1237年 837年 所有SZGR 2.0基因通路
BANDRES应对CARMUSTIN管理24小时DN 33 21 所有SZGR 2.0基因通路
短期伊万诺娃造血干细胞 32 15 所有SZGR 2.0基因通路
伽马辐射KYNG DNA损伤 81年 59 所有SZGR 2.0基因通路
KYNG DNA损伤了 226年 164年 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO和H3K9ME3肝癌 141年 75年 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和发票16易位 422年 277年 所有SZGR 2.0基因通路
金所有障碍CALB1 CORR 548年 370年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-1/206 250年 257年 1、m8 hsa-miR-1 UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
hsa - mir - 206深圳 UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
hsa - mir - 613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC