基因页：ring1
概括？
| 基因 | 6015 |
| 象征 | ring1 |
| 同义词 | ring1a | rnf1 |
| 描述 | 环手指蛋白1 |
| 参考 | MIM：602045|HGNC：HGNC：10018|Ensembl：ENSG00000204227|HPRD：03624|Vega：Otthumg0000000031278 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.3 |
| Pascal P值 | 6.658E-4 |
| Sherlock P值 | 0.004 |
| 胎儿β | -0 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | 染色质重塑基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.033 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12256228 | 6 | 33176613 | ring1 | -0.024 | 0.96 | DMG：Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PRDM4 | 0.93 | 0.93 |
| DDX19A | 0.92 | 0.92 |
| EIF2AK4 | 0.92 | 0.91 |
| FAM120B | 0.92 | 0.92 |
| NOLC1 | 0.91 | 0.91 |
| ABCF2 | 0.91 | 0.90 |
| VPS39 | 0.91 | 0.93 |
| ZFYVE1 | 0.91 | 0.91 |
| Rabgef1 | 0.91 | 0.90 |
| RNF216 | 0.91 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.80 | -0.84 |
| MT-CO2 | -0.79 | -0.79 |
| AF347015.31 | -0.79 | -0.79 |
| AF347015.8 | -0.77 | -0.79 |
| FXYD1 | -0.77 | -0.78 |
| AF347015.33 | -0.75 | -0.75 |
| AF347015.27 | -0.75 | -0.77 |
| mt-cyb | -0.75 | -0.75 |
| higd1b | -0.75 | -0.76 |
| ifi27 | -0.73 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003682 | 染色质结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0004842 | 泛素 - 蛋白连接酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008270 | 锌离子结合 | nas | - | |
| GO：0016564 | 转录阻遏活性 | 艾达 | 9199346 | |
| GO：0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0006511 | 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0009952 | 前/后模式形成 | IEA | - | |
| GO：0016568 | 染色质修饰 | nas | - | |
| GO：0016574 | 组蛋白泛素化 | IEA | - | |
| GO：0048593 | 摄像机型眼形形态发生 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000151 | 泛素连接酶复合物 | IEA | - | |
| 去：0001739 | 性染色质 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 9199346 | |
| 去：0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| GO：0016607 | 核斑点 | IEA | - | |
| GO：0031519 | PCG蛋白质复合物 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BMI1 | MGC12685 |PCGF4 |RNF51 | BMI1 Polycomb环形指癌基因 | RING1与BMI1相互作用。 | 绑定 | 9858531 |
| BMI1 | MGC12685 |PCGF4 |RNF51 | BMI1 Polycomb环形指癌基因 | - | HPRD，Biogrid | 9199346|9858531 |
| CBX2 | CDCA6 |M33 |MGC10561 | Chromobox同源2（PC类同源物，果蝇） | 重构的复合物 | Biogrid | 10369680 |
| CBX4 | NBP16 |PC2 |HPC2 | Chromobox同源物4（PC类同源物，果蝇） | RING1与HPC2相互作用。 | 绑定 | 9858531 |
| CBX4 | NBP16 |PC2 |HPC2 | Chromobox同源物4（PC类同源物，果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 9199346|9858531 |
| CBX7 | - | Chromobox同源物7 | - | HPRD，Biogrid | 14647293 |
| CBX8 | HPC3 |PC3 |RC1 | Chromobox同源物8（PC类同源物，果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 10825164 |
| E2F1 | E2F-1 |RBAP1 |rbbp3 |rbp3 | E2F转录因子1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11583618 |
| E2F6 | E2F-6 |MGC111545 | E2F转录因子6 | - | HPRD，Biogrid | 11171983 |
| ELAC2 | ELC2 |FLJ10530 |FLJ36693 |FLJ42848 |HPC2 | ELAC同源2（大肠杆菌） | - | HPRD | 9199346 |
| FHL1 | FHL1B |flh1a |kyo-t |MGC111107 |Slim1 |XMPMA |BA535K18.1 | 四个半域1 | Kyot与RING1相互作用。这种相互作用是基于未指定物种与人Ring1的Kyot之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15710417 |
| PHC1 | EDR1 |HPH1 |RAE28 | 多性瘤同源物1（果蝇） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9199346 |
| RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | - | HPRD，Biogrid | 11583618 |
| ring1 | ring1a |RNF1 | 环手指蛋白1 | - | HPRD | 9199346 |
| ring1 | ring1a |RNF1 | 环手指蛋白1 | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 9858531 |
| ring1 | ring1a |RNF1 | 环手指蛋白1 | RING1形成同型二聚体。 | 绑定 | 9858531 |
| RYBP | AAP1 |dedaf |是的 | RING1和YY1结合蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 10369680 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dirmeier LMP1响应晚期DN | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stegmeier有丝分裂细胞周期调节剂 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Munshi多发性骨髓瘤 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chiba对TSA的反应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 戴维斯多发性骨髓瘤与mgus | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF间隔DN | 214 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-133 | 26 | 32 | M8 | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||