基因页:RLBP1
概括?
基因 | 6017 |
象征 | RLBP1 |
同义词 | 克拉尔布 |
描述 | 视网膜醛结合蛋白1 |
参考 | MIM:180090|HGNC:HGNC:10024|ENSEMBL:ENSG00000140522|HPRD:01572|Vega:Otthumg00000172884 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 15Q26 |
Pascal P值 | 0.002 |
Sherlock P值 | 0.905 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS950540 | CHR15 | 89754863 | RLBP1 | 6017 | 0.11 | 顺式 | ||
RS950541 | CHR15 | 89754953 | RLBP1 | 6017 | 0.15 | 顺式 | ||
RS17228503 | CHR15 | 89763205 | RLBP1 | 6017 | 0.01 | 顺式 | ||
RS10451012 | CHR15 | 89769904 | RLBP1 | 6017 | 0.02 | 顺式 | ||
RS17228716 | CHR15 | 89773504 | RLBP1 | 6017 | 0.19 | 顺式 | ||
RS2679774 | CHR8 | 98390991 | RLBP1 | 6017 | 0.2 | 反式 | ||
RS7193497 | CHR16 | 89064018 | RLBP1 | 6017 | 0.14 | 反式 | ||
RS17003861 | Chrx | 101204311 | RLBP1 | 6017 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RLBP1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ankrd42 | 0.90 | 0.89 |
GCC2 | 0.89 | 0.89 |
PDE8B | 0.89 | 0.84 |
MFSD6 | 0.89 | 0.85 |
夹子4 | 0.89 | 0.87 |
DDHD2 | 0.89 | 0.87 |
NSF | 0.88 | 0.86 |
NCOA7 | 0.88 | 0.87 |
taf4b | 0.88 | 0.86 |
GPRASP1 | 0.88 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Bcl7c | -0.50 | -0.56 |
RPL35 | -0.47 | -0.51 |
RPL36 | -0.46 | -0.50 |
RPLP1 | -0.45 | -0.48 |
AC006276.2 | -0.44 | -0.41 |
TBC1D10A | -0.43 | -0.34 |
RPL27 | -0.43 | -0.43 |
RPL18 | -0.42 | -0.49 |
fau | -0.42 | -0.41 |
RPL31 | -0.42 | -0.42 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005488 | 捆绑 | 塔斯 | 9326942 | |
去:0005502 | 11-CIS视网膜结合 | IEA | - | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
GO:0019841 | 视黄醇结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007601 | 视觉感知 | 塔斯 | 9326942 | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
去:0006776 | 维生素一种代谢过程 | 塔斯 | 9326942 | |
GO:0050896 | 对刺激的反应 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005625 | 可溶性部分 | 塔斯 | 9326942 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Beier神经胶质瘤干细胞向上 | 39 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |