概括
基因 6017
象征 RLBP1
同义词 克拉尔布
描述 视网膜醛结合蛋白1
参考 MIM:180090|HGNC:HGNC:10024|ENSEMBL:ENSG00000140522|HPRD:01572|Vega:Otthumg00000172884
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q26
Pascal P值 0.002
Sherlock P值 0.905
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS950540 CHR15 89754863 RLBP1 6017 0.11 顺式
RS950541 CHR15 89754953 RLBP1 6017 0.15 顺式
RS17228503 CHR15 89763205 RLBP1 6017 0.01 顺式
RS10451012 CHR15 89769904 RLBP1 6017 0.02 顺式
RS17228716 CHR15 89773504 RLBP1 6017 0.19 顺式
RS2679774 CHR8 98390991 RLBP1 6017 0.2 反式
RS7193497 CHR16 89064018 RLBP1 6017 0.14 反式
RS17003861 Chrx 101204311 RLBP1 6017 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ankrd42 0.90 0.89
GCC2 0.89 0.89
PDE8B 0.89 0.84
MFSD6 0.89 0.85
夹子4 0.89 0.87
DDHD2 0.89 0.87
NSF 0.88 0.86
NCOA7 0.88 0.87
taf4b 0.88 0.86
GPRASP1 0.88 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Bcl7c -0.50 -0.56
RPL35 -0.47 -0.51
RPL36 -0.46 -0.50
RPLP1 -0.45 -0.48
AC006276.2 -0.44 -0.41
TBC1D10A -0.43 -0.34
RPL27 -0.43 -0.43
RPL18 -0.42 -0.49
fau -0.42 -0.41
RPL31 -0.42 -0.42

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005488 捆绑 塔斯 9326942
去:0005502 11-CIS视网膜结合 IEA -
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
GO:0019841 视黄醇结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007601 视觉感知 塔斯 9326942
去:0006810 运输 IEA -
去:0006776 维生素一种代谢过程 塔斯 9326942
GO:0050896 对刺激的反应 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005625 可溶性部分 塔斯 9326942
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由E2F4绑定的Marson未刺激 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Beier神经胶质瘤干细胞向上 39 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因