Gene Page:ELOVL5

概括?
基因 60481
象征 ELOVL5
Synonyms HELO1|SCA38|dJ483K16.1
Description Elovl脂肪酸延伸酶5
Reference MIM:611805|HGNC:HGNC:21308|Ensembl:ENSG00000012660|HPRD：13268|Vega:OTTHUMG00000016249
Gene type protein-coding
Map location 6p12.1
Pascal p-value 0.019
Sherlock p-value 0.36
Fetal beta 0.239
DMG 1（＃研究）
eGene Caudate basal ganglia
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
PMID:cooccur High-throughput literature-search Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
GSMA_IIE 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） Psr: 0.04433
文学 High-throughput literature-search 与精神分裂症Co-occurance关键词:schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias 点击to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

Probe Chromosome Position Nearest gene P (dis) Beta (dis) FDR (dis) Study
cg21195414 6 53213871 ELOVL5 3.71E-4 -0.467 0.043 DMG:Wockner_2014

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance EQTL类型
rs6494052 chr15 59295924 ELOVL5 60481 0.13 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

No co-expressed genes in brain regions


Section III. Gene Ontology annotation

生物过程 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006633 fatty acid biosynthetic process IEA -
Cellular component GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane IEA -
GO:0005783 endoplasmic reticulum IEA -
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 integral to membrane IEA -

V.途径注释

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
不饱和脂肪酸的KEGG生物合成 22 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRIGLYCERIDE BIOSYNTHESIS 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ALPHA LINOLENIC ACID ALA METABOLISM 12 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME FATTY ACYL COA BIOSYNTHESIS 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME FATTY ACID TRIACYLGLYCEROL AND KETONE BODY METABOLISM 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SYNTHESIS OF VERY LONG CHAIN FATTY ACYL COAS 14 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARENT MTOR SIGNALING DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA ERYTHROID DN 493 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUIFFE INVASION INHIBITED BY ASCITES DN 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSMAN BLADDER CANCER DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER GRADES 1 2 DN 67 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS BASAL 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRASEMANN RETINOBLASTOMA WITH 6P AMPLIFICATION 14 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLOSSER SERUM RESPONSE DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS UP 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨乳腺癌ESR1大量 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA2 PCC NETWORK 423 265 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT AND CANCER BOX4 DN 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GEORGES TARGETS OF MIR192 AND MIR215 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC TGFA DN 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CLOCK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC E2F1 DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森对雄激素的反应 86 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC DN 63 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER E2F1 DN 64 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD1 AND CD2 DN 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB TARGETS 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记 191 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS EARLY PROGENITOR 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REN ALVEOLAR RHABDOMYOSARCOMA DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU TNF SIGNALING 4HR 54 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDVALL IMMORTALIZED BY TERT UP 78 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WENG POR TARGETS GLOBAL DN 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENGELMANN CANCER PROGENITORS UP 48 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER UP 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANTVEER BREAST CANCER ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GYORFFY MITOXANTRONE RESISTANCE 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PILON KLF1 TARGETS DN 1972 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE MIDDLE 98 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUILLAUMOND KLF10 TARGETS DN 30 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

mirna家族 Target position mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-124.1 265 271 m8 hsa-miR-124a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
hsa-miR-124a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-124/506 412 418 1A hsa-miR-506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa-miR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
hsa-miR-506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa-miR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-19 1437 1444 1A,m8 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b ugugcaaauccaugcaaaacuga
miR-203.1 192 198 m8 HSA-MIR-203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
miR-218 43 50 1A,m8 HSA-MIR-218brain UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU
miR-30-5p 1518 1525 1A,m8 HSA-MIR-30A-5P UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30cbrain uguaaacauccuacucucucucucagc
hsa-miR-30dSZ uguaaacauccccgacuggaag
hsa-miR-30bSZ UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir-494 464 471 1A,m8 hsa-miR-494brain UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU
mir-496 1408 1414 1A hsa-miR-496 AUUACAUGGCCAAUCUC