基因页面:ELAC2
总结吗?
GeneID | 60528年 |
象征 | ELAC2 |
同义词 | COXPD17 | ELC2 | HPC2 |
描述 | Z elaC核糖核酸酶2 |
参考 | MIM: 605367|HGNC: HGNC: 14198|HPRD: 05641| |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 17 p11.2 |
帕斯卡假定值 | 2.13的军医 |
夏洛克假定值 | 0.412 |
胎儿β | -0.326 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg08011170 | 17 | 12921393 | ELAC2 | 2.07 e-9 | -0.023 | 1.66 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs2523 | 17 | 12895815 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 4.545平台以及 | 0 | 25689年 | gtex_brain_ba24 |
rs1044569 | 17 | 12895929 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 4.545平台以及 | 0 | 25575年 | gtex_brain_ba24 |
rs1044564 | 17 | 12895984 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 2.491平台以及 | 0 | 25520年 | gtex_brain_ba24 |
rs9908102 | 17 | 12896553 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 4.529平台以及 | 0 | 24951年 | gtex_brain_ba24 |
rs9915058 | 17 | 12897293 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 2.98 e - | 0 | 24211年 | gtex_brain_ba24 |
rs62058145 | 17 | 12913490 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 9.182 e-9 | 0 | 8014年 | gtex_brain_ba24 |
rs11658321 | 17 | 12914484 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 3.632 e-8 | 0 | 7020年 | gtex_brain_ba24 |
rs2523 | 17 | 12895815 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 8.95 e-8 | 0.01 | 25689年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs1044569 | 17 | 12895929 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 1.036 e - | 0.01 | 25575年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs9908102 | 17 | 12896553 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 1.11 e-6 | 0.01 | 24951年 | gtex_brain_putamen_basal |
rs11658321 | 17 | 12914484 | ELAC2 | ENSG00000006744.14 | 7.601 e - | 0.01 | 7020年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ELAC2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应表皮 | 293年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
角化细胞DN ENK紫外线反应 | 485年 | 334年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652年 | 1023年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA ATM PCC网络 | 1442年 | 892年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
费雷拉尤因肉瘤不稳定和稳定的DN | 98年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展48小时DN | 428年 | 306年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
布朗感染48小时血巨细胞病毒 | 180年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KAAB心脏心房和心室DN | 261年 | 183年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 | 393年 | 244年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
海勒HDAC DN的目标 | 292年 | 189年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
穆勒PLURINET | 299年 | 189年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ICHIBA移植物抗宿主病35 d的DN | 49 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2 DN的目标 | 882年 | 538年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |