基因页:Prok2
概括?
基因 | 60675 |
象征 | Prok2 |
同义词 | bv8 | hh4 | kal4 | mit1 | pk2 |
描述 | 原动蛋白2 |
参考 | MIM:607002|HGNC:HGNC:18455|ENSEMBL:ENSG00000163421|HPRD:08446|Vega:Otthumg00000158809 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P13 |
Pascal P值 | 0.03 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.04047 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.04359 | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值:1.597 | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PROK2_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0001664 | G蛋白偶联受体结合 | 塔斯 | 12728244 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007218 | 神经肽信号通路 | IEA | 神经递质(GO期限:8) | - |
GO:0000187 | MAPK活动的激活 | 塔斯 | 12728244 | |
去:0001525 | 血管生成 | 艾达 | 12604792 | |
去:0007204 | 胞质钙离子浓度的升高 | 塔斯 | 12728244 | |
去:0007283 | 精子发生 | 小鬼 | 10580115 | |
去:0008283 | 细胞增殖 | 艾达 | 12604792 | |
去:0006954 | 炎症反应 | nas | 11259612 | |
去:0006935 | 趋化性 | 艾达 | 12604792 | |
去:0006916 | 抗凋亡 | 艾达 | 12604792 | |
GO:0019233 | 疼痛的感觉感知 | 塔斯 | 12728244 | |
GO:0045987 | 平滑肌收缩的积极调节 | 艾达 | 11259612 | |
GO:0048511 | 有节奏的过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 塔斯 | 12466223 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Marzec IL2信号传导DN | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kumar自噬网络 | 71 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-369-3p | 1048 | 1054 | 1a | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-374 | 1048 | 1054 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |