概括
基因 60675
象征 Prok2
同义词 bv8 | hh4 | kal4 | mit1 | pk2
描述 原动蛋白2
参考 MIM:607002|HGNC:HGNC:18455|ENSEMBL:ENSG00000163421|HPRD:08446|Vega:Otthumg00000158809
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P13
Pascal P值 0.03

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.04047
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.04359
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.597
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001664 G蛋白偶联受体结合 塔斯 12728244
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007218 神经肽信号通路 IEA 神经递质(GO期限:8) -
GO:0000187 MAPK活动的激活 塔斯 12728244
去:0001525 血管生成 艾达 12604792
去:0007204 胞质钙离子浓度的升高 塔斯 12728244
去:0007283 精子发生 小鬼 10580115
去:0008283 细胞增殖 艾达 12604792
去:0006954 炎症反应 nas 11259612
去:0006935 趋化性 艾达 12604792
去:0006916 抗凋亡 艾达 12604792
GO:0019233 疼痛的感觉感知 塔斯 12728244
GO:0045987 平滑肌收缩的积极调节 艾达 11259612
GO:0048511 有节奏的过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 塔斯 12466223

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2信号传导DN 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kumar自噬网络 71 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-369-3p 1048 1054 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 1048 1054 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug