基因页面:EEFSEC
总结吗?
GeneID | 60678年 |
象征 | EEFSEC |
同义词 | EFSEC | SELB |
描述 | 真核伸长因素,selenocysteine-tRNA-specific |
参考 | MIM: 607695|HGNC: HGNC: 24614|运用:ENSG00000132394|HPRD: 07409|织女:OTTHUMG00000159659 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 3 q21.3 |
帕斯卡假定值 | 0.001 |
夏洛克假定值 | 0.76 |
胎儿β | 0.231 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg27394987 | 3 | 128118189 | EEFSEC | 9.64 e-9 | 0.025 | 4.27 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6692851 | chr1 | 34346561 | EEFSEC | 60678年 | 0.13 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
STRA6 | 0.86 | 0.79 |
PCDH12 | 0.79 | 0.76 |
COL4A2 | 0.77 | 0.79 |
COL4A1 | 0.76 | 0.78 |
NID1 | 0.76 | 0.77 |
MMP2 | 0.75 | 0.76 |
COL6A2 | 0.75 | 0.63 |
CD248 | 0.75 | 0.64 |
PCOLCE | 0.74 | 0.59 |
FLVCR2 | 0.74 | 0.58 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.46 | -0.55 |
AF347015.27 | -0.44 | -0.55 |
AF347015.33 | -0.44 | -0.56 |
CSRP1 | -0.43 | -0.46 |
MT-CO2 | -0.43 | -0.55 |
CYP2J2 | -0.43 | -0.53 |
AF347015.31 | -0.42 | -0.53 |
HLA-F | -0.42 | -0.44 |
SEPT4 | -0.42 | -0.52 |
PIR | -0.42 | -0.53 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN FEVR CTNNB1目标 | 553年 | 343年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |