概括
基因 60682
象征 SMAP1
同义词 SMAP-1
描述 小arfgap 1
参考 MIM:611372|HGNC:HGNC:19651|Ensembl:ENSG00000112305|HPRD:18072|Vega:Otthumg0000000014996
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q13
Pascal P值 0.15
Sherlock P值 9.269E-4
胎儿β 0.478
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008270 锌离子结合 IEA -
去:0008060 ARF GTPase激活剂活性 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0032312 ARF GTPase活性的调节 IEA -
GO:0045648 红细胞分化的阳性调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG内吞作用 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2目标 424 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向 100 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应17 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir1靶向 53 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 2类由EGF瞬时诱导 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 37 43 M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-10 688 695 1A,M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-130/301 674 680 1a HSA-MIR-130A cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-181 429 435 1a HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-193 375 381 1a HSA-MIR-193A Aacuggccuacaaagucccag
HSA-MIR-193B aacuggcccucaaagucccgcuuu
mir-22 202 208 M8 HSA-MIR-22 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-320 204 210 M8 HSA-MIR-320 aaaagcugggugagaggggcgaa
mir-339 523 529 1a HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-496 431 437 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc