基因页:SMAP1
概括?
基因 | 60682 |
象征 | SMAP1 |
同义词 | SMAP-1 |
描述 | 小arfgap 1 |
参考 | MIM:611372|HGNC:HGNC:19651|Ensembl:ENSG00000112305|HPRD:18072|Vega:Otthumg0000000014996 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q13 |
Pascal P值 | 0.15 |
Sherlock P值 | 9.269E-4 |
胎儿β | 0.478 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SMAP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
去:0008060 | ARF GTPase激活剂活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0032312 | ARF GTPase活性的调节 | IEA | - | |
GO:0045648 | 红细胞分化的阳性调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir1靶向 | 53 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 2类由EGF瞬时诱导 | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-1/206 | 37 | 43 | M8 | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
mir-10 | 688 | 695 | 1A,M8 | HSA-MIR-10A | uacccuguagauccgaauuugug |
HSA-MIR-10B | uacccuguagaaccgaauuugu | ||||
mir-130/301 | 674 | 680 | 1a | HSA-MIR-130A脑 | cagugcaauguaaaaggggau |
HSA-MIR-301 | cagugcaauaugucaaagc | ||||
HSA-MIR-130b脑 | Cagugcaaugaagggauggau | ||||
HSA-MIR-454-3P | uagugcaauauugcuuauaggguuu | ||||
mir-181 | 429 | 435 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-193 | 375 | 381 | 1a | HSA-MIR-193A | Aacuggccuacaaagucccag |
HSA-MIR-193B | aacuggcccucaaagucccgcuuu | ||||
mir-22 | 202 | 208 | M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
mir-320 | 204 | 210 | M8 | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
mir-339 | 523 | 529 | 1a | HSA-MIR-339 | ucccuccuccaggagcuca |
mir-496 | 431 | 437 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |