基因页面:ZFAND3
总结吗?
GeneID | 60685年 |
象征 | ZFAND3 |
同义词 | TEX27 |
描述 | 锌指AN1-type包含3 |
参考 | MIM: 607455|HGNC: HGNC: 18019|运用:ENSG00000156639|HPRD: 12121|织女:OTTHUMG00000014629 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 6 p21.2 |
帕斯卡假定值 | 0.04 |
夏洛克假定值 | 0.436 |
胎儿β | 0.386 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.033 | |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.04433 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg06021784 | 6 | 38092211 | ZFAND3 | 1.282的军医 | 0.273 | 0.03 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs924039 | chr6 | 170362119 | ZFAND3 | 60685年 | 0.2 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZFAND3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
加里CD5目标了 | 473年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
奥斯曼膀胱癌了 | 404年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
巨噬细胞培养宽容了 | 156年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
了吉西他滨抵抗了 | 79年 | 40 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KYNG正常老化DN | 30. | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KYNG WERNER症侯群DN | 29日 | 14 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
王GSK3反应抑制剂SB216763 | 397年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 101 | 142年 | 149年 | 1、m8 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
mir - 124.1 | 312年 | 318年 | 1 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
miR-124/506 | 483年 | 489年 | m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir - 139 | 144年 | 150年 | m8 | hsa - mir - 139大脑 | UCUACAGUGCACGUGUCU |
mir - 142 - 5 - p | 2183年 | 2189年 | m8 | hsa - mir - 142 - 5 - p | CAUAAAGUAGAAAGCACUAC |
mir - 144 | 143年 | 149年 | 1 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
mir - 149 | 70年 | 76年 | 1 | hsa - mir - 149大脑 | UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCC |
mir - 186 | 122年 | 128年 | 1 | hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU |
hsa - mir - 186 | CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU | ||||
mir - 214 | 2200年 | 2207年 | 1、m8 | hsa - mir - 214大脑 | ACAGCAGGCACAGACAGGCAG |
miR-27 | 2028年 | 2034年 | 1 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
mir - 299 - 5 - p | 2218年 | 2224年 | 1 | hsa - mir - 299 - 5 - p | UGGUUUACCGUCCCACAUACAU |
mir - 338 | 289年 | 295年 | 1 | hsa - mir - 338大脑 | UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA |
mir - 381 | 212年 | 218年 | 1 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU | ||||
mir - 495 | 2035年 | 2042年 | 1、m8 | hsa - mir - 495大脑 | AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU |
mir - 542 - 3 - p | 282年 | 288年 | m8 | hsa - mir - 542 - 3 - p | UGUGACAGAUUGAUAACUGAAA |
mir - 543 | 43 | 49 | 1 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |