基因页：ROBO2

概括？
基因 6092
象征 ROBO2
同义词 SAX3
描述 回旋处指导受体2
参考 MIM：602431|HGNC：HGNC：10250|ENSEMBL：ENSG00000185008|Vega：Otthumg00000158935
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P12.3
胎儿β 1.021
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞粘附和透射信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.04047
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.04359
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS9882137 CHR3 29494146 ROBO2 6092 0.02 反式
RS9882501 CHR3 29494429 ROBO2 6092 0.16 反式
RS4491879 CHR3 189373908 ROBO2 6092 0.05 反式
RS4505678 CHR3 189374356 ROBO2 6092 0.08 反式
RS9368571 CHR6 28677757 ROBO2 6092 0.17 反式
RS9257144 CHR6 28729980 ROBO2 6092 0.11 反式
RS16894557 CHR6 28999825 ROBO2 6092 0.01 反式
RS1503026 CHR18 70842605 ROBO2 6092 0.16 反式
RS12326929 CHR18 70864592 ROBO2 6092 0.1 反式
RS12327665 CHR19 39622639 ROBO2 6092 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
tut1 0.99 0.95
EIF3H 0.98 0.93
IGBP1 0.97 0.94
EIF3L 0.97 0.95
NACA 0.96 0.95
AC005393.1 0.96 0.91
BTF3 0.96 0.97
RPS8 0.96 0.88
VPS72 0.96 0.93
RPL5 0.96 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.70 -0.76
AIFM3 -0.68 -0.75
FBXO2 -0.68 -0.66
C5orf53 -0.67 -0.67
LDHD -0.66 -0.67
tinagl1 -0.65 -0.77
AF347015.27 -0.65 -0.81
aldoc -0.65 -0.68
克鲁 -0.65 -0.68
pth1r -0.65 -0.69

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0008046 轴突引导受体活性 nas Axon（GO术语级别：6） 9458045
GO：0042802 相同的蛋白质结合 艾达 12504588
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007420 大脑发育 IEP 大脑（GO期限：7） 10197527
GO：0050772 轴突发生的阳性调控 艾达 轴突，神经发生（GO期限：14） 12504588
去：0001657 输尿管芽开发 小鬼 15130495
去：0007155 细胞粘附 IEA -
去：0007156 同粒细胞粘附 艾达 12504588
去：0006935 趋化性 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0009986 细胞表面 艾达 12504588

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Robo受体的反应组信号传导 30 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Cisplatin抗性DN 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时DN 428 306 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
突变率丁肺癌 20 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞向上 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 38 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 126 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常老化DN 225 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 513 520 1A，M8 HSA-MIR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-130/301 428 434 M8 HSA-MIR-130A脑 cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b脑 Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-144 514 520 1a HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag
mir-148/152 429 435 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-153 296 303 1A，M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-18 190 196 1a HSA-MIR-18A uaagguggaugugcagaua
HSA-MIR-18B uaaggugcaucuagugcagua
mir-181 493 499 M8 HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-185 934 940 1a HSA-MIR-185脑 Uggagaaaggcaguuc
mir-19 427 433 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-218 453 460 1A，M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-23 495 502 1A，M8 HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
HSA-MIR-23A脑 aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B脑 aucacauugccagggauuacc
mir-25/32/92/363/367 76 82 M8 HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-323 495 501 1a HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-33 115 121 1a HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-378 207 213 M8 HSA-MIR-378 cuccugacuccaggucugugu
mir-448 297 303 1a HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-496 121 127 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc