概括
基因 6096
象征 罗布
同义词 nr1f2 | ror-beta | rzr-beta | rzrb | ba133m9.1
描述 RAR相关的孤儿受体B
参考 MIM:601972|HGNC:HGNC:10259|Ensembl:ENSG00000198963|HPRD:09062|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9Q22
Pascal P值 0.023
胎儿β 0.065
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14170313 9 77112896 罗布 1.65e-5 -0.445 0.015 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS3769467 CHR2 201205340 罗布 6096 0.17 反式
RS3769461 CHR2 201222657 罗布 6096 0.17 反式
RS17542055 CHR7 42652803 罗布 6096 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPS8 0.96 0.91
RPS24 0.96 0.92
tut1 0.96 0.93
RPL30 0.95 0.90
RPS25P8 0.95 0.90
NACA 0.95 0.91
EIF3H 0.95 0.91
RPL4 0.94 0.94
RPL5 0.94 0.93
RPL23 0.94 0.89
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATP10A -0.64 -0.79
HLA-F -0.63 -0.74
tinagl1 -0.62 -0.78
apol1 -0.61 -0.79
AIFM3 -0.61 -0.71
FBXO2 -0.61 -0.66
LDHD -0.59 -0.67
apol3 -0.59 -0.78
SLC6A12 -0.59 -0.76
pth1r -0.59 -0.69

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome通用转录途径 352 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome核受体转录途径 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄端癌DN 82 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlingemann皮肤致癌作用TPA 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移DN 61 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨Bcl3靶向 364 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma S向上 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因