基因页:罗布
概括?
基因 | 6096 |
象征 | 罗布 |
同义词 | nr1f2 | ror-beta | rzr-beta | rzrb | ba133m9.1 |
描述 | RAR相关的孤儿受体B |
参考 | MIM:601972|HGNC:HGNC:10259|Ensembl:ENSG00000198963|HPRD:09062| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9Q22 |
Pascal P值 | 0.023 |
胎儿β | 0.065 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14170313 | 9 | 77112896 | 罗布 | 1.65e-5 | -0.445 | 0.015 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS3769467 | CHR2 | 201205340 | 罗布 | 6096 | 0.17 | 反式 | ||
RS3769461 | CHR2 | 201222657 | 罗布 | 6096 | 0.17 | 反式 | ||
RS17542055 | CHR7 | 42652803 | 罗布 | 6096 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RORB_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RPS8 | 0.96 | 0.91 |
RPS24 | 0.96 | 0.92 |
tut1 | 0.96 | 0.93 |
RPL30 | 0.95 | 0.90 |
RPS25P8 | 0.95 | 0.90 |
NACA | 0.95 | 0.91 |
EIF3H | 0.95 | 0.91 |
RPL4 | 0.94 | 0.94 |
RPL5 | 0.94 | 0.93 |
RPL23 | 0.94 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ATP10A | -0.64 | -0.79 |
HLA-F | -0.63 | -0.74 |
tinagl1 | -0.62 | -0.78 |
apol1 | -0.61 | -0.79 |
AIFM3 | -0.61 | -0.71 |
FBXO2 | -0.61 | -0.66 |
LDHD | -0.59 | -0.67 |
apol3 | -0.59 | -0.78 |
SLC6A12 | -0.59 | -0.76 |
pth1r | -0.59 | -0.69 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome核受体转录途径 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄端癌DN | 82 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlingemann皮肤致癌作用TPA | 42 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramaswamy转移DN | 61 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卡mir302a目标 | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |