基因页：HCN2
概括？
| 基因 | 610 |
| 象征 | HCN2 |
| 同义词 | BCNG-2 | BCNG2 | HAC-1 |
| 描述 | 超极化激活的环状核苷酸门钾通道2 |
| 参考 | MIM：602781|HGNC：HGNC：4846|Ensembl：ENSG0000000099822|HPRD：07213|Vega：Otthumg00000180590 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19p13.3 |
| Pascal P值 | 0.117 |
| Sherlock P值 | 0.066 |
| 胎儿β | -0.937 |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FAM171A1 | 0.89 | 0.88 |
| ULK1 | 0.87 | 0.89 |
| SRF | 0.85 | 0.91 |
| AKAP1 | 0.84 | 0.86 |
| mesdc1 | 0.83 | 0.84 |
| Rapgef1 | 0.83 | 0.89 |
| WDTC1 | 0.82 | 0.88 |
| rundc1 | 0.82 | 0.86 |
| dab2ip | 0.82 | 0.88 |
| FAM168B | 0.82 | 0.87 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.68 | -0.76 |
| AF347015.31 | -0.63 | -0.67 |
| MT-CO2 | -0.62 | -0.66 |
| C1orf54 | -0.62 | -0.74 |
| GNG11 | -0.60 | -0.67 |
| Sycp3 | -0.60 | -0.68 |
| AF347015.8 | -0.59 | -0.64 |
| higd1b | -0.58 | -0.65 |
| 鼻孔 | -0.58 | -0.63 |
| myl3 | -0.57 | -0.62 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005244 | 电压门控离子通道活性 | IEA | - | |
| 去：0005249 | 电压门控钾通道活动 | IEA | - | |
| 去：0005272 | 钠通道活性 | IEA | - | |
| GO：0030552 | 营地约束 | IEA | - | |
| 去：0030955 | 钾离子结合 | IEA | - | |
| GO：0031402 | 钠离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007267 | 细胞细胞信号传导 | 塔斯 | 9630217 | |
| 去：0006814 | 钠离子运输 | IEA | - | |
| 去：0006812 | 阳离子运输 | 塔斯 | 10228147 | |
| 去：0006813 | 钾离子运输 | IEA | - | |
| 去：0006936 | 肌肉收缩 | 塔斯 | 10228147 | |
| GO：0042391 | 调节膜电位 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0008076 | 电压门控钾通道复合物 | 塔斯 | 9630217 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome神经元系统 | 279 | 221 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome钾通道 | 98 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Delta FOSB目标8WK | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein少突胶质细胞 | 74 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Pons标记 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Coulouarn颞TGFB1签名DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-135 | 60 | 66 | M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga | ||||
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-181 | 580 | 587 | 1A，M8 | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
| HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
| HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
| HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
| mir-25/32/92/363/367 | 391 | 398 | 1A，M8 | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
| HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
| HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
| HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
| HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
| mir-9 | 56 | 62 | M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |