基因页面:RP9

总结吗?
GeneID 6100年
象征 RP9
同义词 PAP-1 | PAP1
描述 色素性视网膜炎9(常染色体显性遗传)
参考 MIM: 607331|HGNC: HGNC: 10288|运用:ENSG00000164610|HPRD: 08457|织女:OTTHUMG00000152988
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 7 p14.3
帕斯卡假定值 0.605
夏洛克假定值 0.472
胎儿β 0.698
DMG 1(#研究)
eGene 前扣带皮层BA24
尾状基底神经节
小脑
皮质
海马体
伏隔核基底神经节

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg13464062 7 33148868 RP9 2.03 e-8 -0.014 7.02 e-6 DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs112671824 7 32916744 RP9 ENSG00000164610.4 2.098 e-6 0.01 232258年 gtex_brain_ba24
rs7804202 7 32924438 RP9 ENSG00000164610.4 2.098 e-6 0.01 224564年 gtex_brain_ba24
rs62467397 7 32951554 RP9 ENSG00000164610.4 2.089 e-6 0.01 197448年 gtex_brain_ba24
rs17468799 7 32953216 RP9 ENSG00000164610.4 5.145 e - 0.01 195786年 gtex_brain_ba24
rs2893441 7 32961379 RP9 ENSG00000164610.4 5.145 e - 0.01 187623年 gtex_brain_ba24
rs73101892 7 32963898 RP9 ENSG00000164610.4 5.145 e - 0.01 185104年 gtex_brain_ba24
rs17469596 7 32972245 RP9 ENSG00000164610.4 9.488 e-8 0.01 176757年 gtex_brain_ba24
rs115737524 7 32980083 RP9 ENSG00000164610.4 3.286 e - 0.01 168919年 gtex_brain_ba24
rs71690504 7 32980883 RP9 ENSG00000164610.4 3.251 e - 0.01 168119年 gtex_brain_ba24
rs200051770 7 32983802 RP9 ENSG00000164610.4 2.945 e - 0.01 165200年 gtex_brain_ba24
rs62467426 7 32984247 RP9 ENSG00000164610.4 3.163 e - 0.01 164755年 gtex_brain_ba24
rs28882699 7 32984286 RP9 ENSG00000164610.4 3.163 e - 0.01 164716年 gtex_brain_ba24
rs60403301 7 32984635 RP9 ENSG00000164610.4 3.144 e - 0.01 164367年 gtex_brain_ba24
rs62467427 7 32994114 RP9 ENSG00000164610.4 9.237 e-8 0.01 154888年 gtex_brain_ba24
rs10252042 7 32994461 RP9 ENSG00000164610.4 4.287 e - 0.01 154541年 gtex_brain_ba24
rs4720087 7 32995331 RP9 ENSG00000164610.4 7.479 e-8 0.01 153671年 gtex_brain_ba24
rs73103724 7 32996603 RP9 ENSG00000164610.4 1.795 e - 0.01 152399年 gtex_brain_ba24
rs13437907 7 32997029 RP9 ENSG00000164610.4 7.361 e-8 0.01 151973年 gtex_brain_ba24
rs28432929 7 32997523 RP9 ENSG00000164610.4 7.315 e-8 0.01 151479年 gtex_brain_ba24
rs10266139 7 32999498 RP9 ENSG00000164610.4 7.145 e-8 0.01 149504年 gtex_brain_ba24
rs10251280 7 32999884 RP9 ENSG00000164610.4 6.979 e-8 0.01 149118年 gtex_brain_ba24
rs10255445 7 33001142 RP9 ENSG00000164610.4 4.836 e-8 0.01 147860年 gtex_brain_ba24
rs10259453 7 33001824 RP9 ENSG00000164610.4 4.353 e-8 0.01 147178年 gtex_brain_ba24
rs4720088 7 33003601 RP9 ENSG00000164610.4 3.218 e-8 0.01 145401年 gtex_brain_ba24
rs4723226 7 33003687 RP9 ENSG00000164610.4 3.194 e-8 0.01 145315年 gtex_brain_ba24
rs4723227 7 33003783 RP9 ENSG00000164610.4 2.03 e - 0.01 145219年 gtex_brain_ba24

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPS9 0.95 0.95
RPL13A 0.95 0.95
RPL18 0.95 0.94
RPS19P3 0.95 0.90
RPS3P3 0.94 0.93
RPS15P5 0.94 0.93
能力 0.94 0.94
RPS18 0.94 0.92
RPL10A 0.94 0.91
RPS11P5 0.94 0.91
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
APOL1 -0.61 -0.76
EPB41L2 -0.61 -0.73
ATP10A -0.60 -0.71
APOL3 -0.60 -0.76
SYNM -0.59 -0.69
ABCB1 -0.59 -0.70
SLC6A12 -0.59 -0.71
HLA-F -0.58 -0.66
MAP3K5 -0.58 -0.65
PTPRB -0.58 -0.66

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
VECCHI胃癌早期 430年 232年 所有SZGR 2.0基因通路
英格拉姆嘘目标了 127年 79年 所有SZGR 2.0基因通路
郑受FOXP3 491年 310年 所有SZGR 2.0基因通路
麦凯布受HOXC6 469年 239年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应迟 1137年 655年 所有SZGR 2.0基因通路