基因页：RPE
概括？
| 基因 | 6120 |
| 象征 | RPE |
| 同义词 | RPE2-1 |
| 描述 | 核糖-5-磷酸3-二聚酶 |
| 参考 | MIM：180480|HGNC：HGNC：10293|ENSEMBL：ENSG00000197713|HPRD：01608| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2q32-Q33.3 |
| Pascal P值 | 0.787 |
| Sherlock P值 | 0.528 |
| 胎儿β | 0.23 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01016 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00916 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RPL35A | 0.97 | 0.94 |
| RPS6 | 0.95 | 0.95 |
| RPS3AP47 | 0.95 | 0.93 |
| RPL30 | 0.95 | 0.93 |
| RPS8 | 0.94 | 0.92 |
| RPS25P8 | 0.94 | 0.93 |
| RPL27 | 0.93 | 0.93 |
| RPS20 | 0.93 | 0.93 |
| RPL38 | 0.93 | 0.89 |
| RPS16P1 | 0.93 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ZBTB47 | -0.63 | -0.75 |
| ATP10A | -0.62 | -0.78 |
| synm | -0.61 | -0.80 |
| EPB41L2 | -0.60 | -0.77 |
| apol1 | -0.60 | -0.77 |
| SLC6A12 | -0.60 | -0.78 |
| PK4P | -0.60 | -0.71 |
| BCl2L2 | -0.59 | -0.76 |
| ABCB1 | -0.59 | -0.74 |
| ptprb | -0.59 | -0.73 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747 | |
| 去：0004750 | 核糖 - 磷酸3-二聚酶活性 | 经验 | 2581946 | |
| 去：0004750 | 核糖 - 磷酸3-二聚酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016853 | 异构酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005975 | 碳水化合物代谢过程 | IEA | - | |
| 去：0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | 经验 | 2581946 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG戊糖磷酸盐途径 | 27 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG五戊糖和葡萄糖酸酯互连 | 28 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 碳水化合物的反应组代谢 | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房正常导管与小叶 | 68 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼转移 | 344 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer生存DN | 175 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang EGF持续DN | 61 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-1/206 | 117 | 123 | 1a | HSA-MIR-1 | Uggaauguaaagaaguaugua |
| HSA-MIR-206SZ | Uggaauguaaggaagugugugg | ||||
| HSA-MIR-613 | aggaauguucuuugcc | ||||
| mir-145 | 45 | 51 | 1a | HSA-MIR-145 | guccaguuucccaggaaucccuu |
| mir-208 | 294 | 300 | 1a | HSA-MIR-208 | auaagacgaaaaaagcuugu |
| mir-382 | 1714年 | 1720年 | M8 | HSA-MIR-382脑 | Gaaguuucgugguggauucg |
| mir-493-5p | 1761年 | 1767年 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
| mir-499 | 294 | 300 | 1a | HSA-MIR-499 | uuaagacuugcagugauguuaa |