基因页：RPL5
概括？
| 基因 | 6125 |
| 象征 | RPL5 |
| 同义词 | DBA6 | L5 | MSTP030 | PPP1R135 |
| 描述 | 核糖体蛋白L5 |
| 参考 | MIM：603634|HGNC：HGNC：10360|ENSEMBL：ENSG00000122406|HPRD：04699|Vega：Otthumg0000000010899 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p22.1 |
| Pascal P值 | 0.061 |
| Sherlock P值 | 0.179 |
| 胎儿β | 0.999 |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0064 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RPL5 | CHR1 | 93307363 | C | t | NM_000969 NM_001252273 |
p.279r> w 。 |
错过 内含子 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RPS25P8 | 0.96 | 0.96 |
| RPL38 | 0.96 | 0.94 |
| RPL37A | 0.96 | 0.95 |
| RPS24 | 0.95 | 0.94 |
| RPS8 | 0.95 | 0.95 |
| RPL23 | 0.94 | 0.94 |
| RPS27A | 0.94 | 0.90 |
| RPL26 | 0.94 | 0.91 |
| RPL30 | 0.94 | 0.94 |
| RPS23 | 0.94 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ATP10A | -0.61 | -0.79 |
| BCl2L2 | -0.59 | -0.82 |
| synm | -0.57 | -0.79 |
| MAP3K5 | -0.57 | -0.75 |
| ptprb | -0.57 | -0.74 |
| ACSL6 | -0.57 | -0.76 |
| EPB41L2 | -0.57 | -0.76 |
| LDHD | -0.56 | -0.71 |
| VWA5B2 | -0.56 | -0.78 |
| PK4P | -0.56 | -0.70 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003735 | 核糖体的结构成分 | IEA | - | |
| 去：0003735 | 核糖体的结构成分 | 塔斯 | 7772601 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 9465063|12054647 | |
| 去：0008097 | 5S rRNA结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006414 | 翻译伸长 | 经验 | 15189156 | |
| 去：0006412 | 翻译 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | 经验 | 14567916 | |
| 去：0005840 | 核糖体 | IEA | - | |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| GO：0022625 | 胞质大核糖体亚基 | 塔斯 | 7772601 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CSNK2A1 | CK2A1 |CKII | 酪蛋白激酶2，α1多肽 | - | HPRD，Biogrid | 10491318 |
| CSNK2B | CK2B |CK2N |CSK2B |g5a |MGC138222 |MGC138224 | 酪蛋白激酶2，β多肽 | - | HPRD | 8806611|9042965 |9738462|10491318 |
| CSNK2B | CK2B |CK2N |CSK2B |g5a |MGC138222 |MGC138224 | 酪蛋白激酶2，β多肽 | 两个杂交 | Biogrid | 8806611|9042965 |11710515|14667819 |
| EIF5A | A |EIF-5A |EIF5A1 |MGC104255 |MGC99547 |uorf | 真核翻译起始因子5a | - | HPRD，Biogrid | 9465063 |
| 野蛮 | FLJ20491 |HRS | 组酰基-TRNA合成酶 | - | HPRD，Biogrid | 8049265 |
| IPO13 | imp13 |kap13 |KIAA0724 |RANBP13 | Importin 13 | 重构的复合物 | Biogrid | 11447110 |
| IPO5 | DKFZP686O1576 |FLJ43041 |IMB3 |kpnb3 |MGC2068 |RANBP5 | Importin 5 | - | HPRD，Biogrid | 9687515 |
| IPO7 | FLJ14581 |imp7 |MGC138673 |RANBP7 | Importin 7 | - | HPRD，Biogrid | 9687515 |
| MDM2 | HDMX |MGC71221 |HDM2 | MDM2 p53结合蛋白同源物（小鼠） | - | HPRD，Biogrid | 7935455|14612427 |
| PDCD4 | H731 |MGC33046 |MGC33047 | 程序性细胞死亡4（肿瘤转化抑制剂） | - | HPRD，Biogrid | 12054647 |
| RPL5 | MGC117339 |MSTP030 | 核糖体蛋白L5 | 蛋白-RNA 两个杂交 |
Biogrid | 10491318|15231747 |
| TNPO1 | IPO2 |kpnb2 |mip |MIP1 |trn | 运输1 | - | HPRD，Biogrid | 9687515 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg核糖体 | 88 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID P53调节途径 | 59 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome SRP依赖性共通晶蛋白靶向膜 | 179 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组肽链伸长 | 153 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome 3 UTR介导的翻译调节 | 176 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome流感病毒RNA转录和复制 | 169 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 | 176 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌6小时 | 55 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过HIF1A的总缺氧 | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤区分良好，而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu IL4信号传导 | 94 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江龄大脑皮层 | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 莫迪海马产前 | 42 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng对H2O2的响应 | 71 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小儿小儿所有疗法反应 | 53 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| iritani mad1靶向DN | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gregory合成致死与伊马替尼 | 145 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 双龙血清和雷帕霉素敏感基因 | 68 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Tial1目标 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍尔曼天冬酰胺酶抗性B | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-376 | 13 | 19 | M8 | HSA-MIR-376A | aucauagaaaaauccacgu |
| HSA-MIR-376B | aucauagaaaaauccauguu | ||||