概括
基因 6135
象征 RPL11
同义词 dba7 | gig34 | l11
描述 核糖体蛋白L11
参考 MIM:604175|HGNC:HGNC:10301|ENSEMBL:ENSG00000142676|HPRD:10364|Vega:Otthumg00000002926
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.1-p35
Pascal P值 0.978
Sherlock P值 0.687
胎儿β 0.882
DMG 1(#研究)
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG07509155 1 24514412 RPL11 4.195E-4 3.686 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPS11P5 0.96 0.93
RPL19P12 0.95 0.92
RPS15P5 0.94 0.88
rps19p3 0.94 0.93
RPL37A 0.94 0.96
RPS12 0.94 0.93
RPL26 0.94 0.92
RPL11 0.94 0.91
RPL28 0.94 0.90
RPS15A 0.93 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATP10A -0.56 -0.76
EDN3 -0.56 -0.71
ptprb -0.55 -0.73
MAP3K5 -0.55 -0.76
ACSL6 -0.55 -0.78
ABCB1 -0.55 -0.70
synm -0.54 -0.78
BCl2L2 -0.54 -0.78
EPB41L2 -0.54 -0.74
FBXO2 -0.54 -0.68

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg核糖体 88 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC活动途径 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53调节途径 59 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome翻译 222 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SRP依赖性共通晶蛋白靶向膜 179 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽链伸长 153 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 176 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感病毒RNA转录和复制 169 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 176 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bogni治疗与髓样白血病有关 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pomeroy髓母细胞瘤预后DN 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1目标 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙雷帕霉素敏感基因 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍尔曼天冬酰胺酶抗性B 26 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍尔曼天冬酰胺酶抗性全部 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因