基因页:RPL11
概括?
基因 | 6135 |
象征 | RPL11 |
同义词 | dba7 | gig34 | l11 |
描述 | 核糖体蛋白L11 |
参考 | MIM:604175|HGNC:HGNC:10301|ENSEMBL:ENSG00000142676|HPRD:10364|Vega:Otthumg00000002926 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.1-p35 |
Pascal P值 | 0.978 |
Sherlock P值 | 0.687 |
胎儿β | 0.882 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG07509155 | 1 | 24514412 | RPL11 | 4.195E-4 | 3.686 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RPL11_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RPS11P5 | 0.96 | 0.93 |
RPL19P12 | 0.95 | 0.92 |
RPS15P5 | 0.94 | 0.88 |
rps19p3 | 0.94 | 0.93 |
RPL37A | 0.94 | 0.96 |
RPS12 | 0.94 | 0.93 |
RPL26 | 0.94 | 0.92 |
RPL11 | 0.94 | 0.91 |
RPL28 | 0.94 | 0.90 |
RPS15A | 0.93 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ATP10A | -0.56 | -0.76 |
EDN3 | -0.56 | -0.71 |
ptprb | -0.55 | -0.73 |
MAP3K5 | -0.55 | -0.76 |
ACSL6 | -0.55 | -0.78 |
ABCB1 | -0.55 | -0.70 |
synm | -0.54 | -0.78 |
BCl2L2 | -0.54 | -0.78 |
EPB41L2 | -0.54 | -0.74 |
FBXO2 | -0.54 | -0.68 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg核糖体 | 88 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MYC活动途径 | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53调节途径 | 59 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SRP依赖性共通晶蛋白靶向膜 | 179 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽链伸长 | 153 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 | 176 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感病毒RNA转录和复制 | 169 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 | 176 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bogni治疗与髓样白血病有关 | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 | 151 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植被拒绝与OK DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pomeroy髓母细胞瘤预后DN | 43 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙雷帕霉素敏感基因 | 39 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍尔曼天冬酰胺酶抗性B | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍尔曼天冬酰胺酶抗性全部 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |