概括
基因 6155
象征 RPL27
同义词 L27
描述 核糖体蛋白L27
参考 MIM:607526|HGNC:HGNC:10328|ENSEMBL:ENSG00000131469|HPRD:09602|Vega:Otthumg00000180660
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q21
Pascal P值 0.024
Sherlock P值 0.787
胎儿beta 0.276
DMG 1(#研究)
耶和华 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMANPSD
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组关联研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136例对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06366151 17 41150311 RPL27 2.83E-9 -0.024 2.01E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 耶和华 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS5767669 CHR22 47707792 RPL27 6155 0.15 反式
RS11090760 0 RPL27 6155 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共同表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPL10A 0.98 0.96
RPL18 0.98 0.95
RPS8 0.97 0.97
RPS16P1 0.97 0.96
RPL13A 0.96 0.94
RPS5 0.96 0.97
tut1 0.96 0.92
rps19p3 0.96 0.97
RPS11P5 0.96 0.97
RPL30 0.95 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATP10A -0.61 -0.75
EPB41L2 -0.61 -0.77
apol1 -0.61 -0.74
FBXO2 -0.61 -0.69
BCl2L2 -0.60 -0.76
synm -0.60 -0.78
MAP3K5 -0.60 -0.73
HLA-F -0.60 -0.66
SLC6A12 -0.59 -0.76
ARHGAP22 -0.59 -0.72

V.途径注释

路径名 路径大小 #SZGR 2.0途径中的基因 信息
kegg核糖体 88 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome翻译 222 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SRP依赖性共透明蛋白靶向膜 179 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽链伸长 153 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 176 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感病毒RNA转录和复制 169 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胡说八道介导的衰减增强了外显子连接络合物 176 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson对砷的回应 217 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HIF1A靶向DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer存活DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小儿小儿所有疗法反应 53 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S2 115 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC绑定的Dang 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸反应dn 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙雷帕霉素敏感基因 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因