概括
基因 6156
象征 RPL30
同义词 L30
描述 核糖体蛋白L30
参考 MIM:180467|HGNC:HGNC:10333|ENSEMBL:ENSG00000156482|HPRD:01595|Vega:Otthumg00000164796
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q22
Pascal P值 0.718
Sherlock P值 0.306
胎儿β 0.357
DMG 1(#研究)
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG11713008 8 99129222 RPL30 0.003 6.76 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPL24 0.95 0.93
C17orf45 0.92 0.94
RPS6 0.92 0.89
rps3p3 0.92 0.92
RPS8 0.92 0.93
RPS23 0.91 0.95
PSMA2 0.91 0.88
RPL15 0.91 0.89
RPL5 0.90 0.89
RPS18 0.90 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ZBTB47 -0.62 -0.68
ATP10A -0.62 -0.76
SLC6A12 -0.61 -0.78
BCl2L2 -0.61 -0.76
ZBTB7B -0.61 -0.80
EPB41L2 -0.61 -0.76
EPAS1 -0.61 -0.83
AL132868.3 -0.60 -0.73
synm -0.60 -0.75
myh14 -0.60 -0.81

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg核糖体 88 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome翻译 222 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SRP依赖性共透明蛋白靶向膜 179 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽链伸长 153 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 176 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感病毒RNA转录和复制 169 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 176 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨型性白血病DN 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tong与PTTG1互动 57 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON 132 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G1 67 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马洛尼对17AAG DN的回应 79 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nutt GBM与AO Glioma DN 45 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI假足趋化性DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙血清和雷帕霉素敏感基因 68 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因