基因页:RPL37A
概括?
基因 | 6168 |
象征 | RPL37A |
同义词 | L37A |
描述 | 核糖体蛋白L37a |
参考 | MIM:613314|HGNC:HGNC:10348|HPRD:17997| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q35 |
Pascal P值 | 0.016 |
Sherlock P值 | 0.432 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01016 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00916 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG02590972 | 2 | 217363392 | RPL37A | 2.45e-8 | -0.012 | 7.95e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RPL37A_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PFDN5 | 0.90 | 0.91 |
RPL35 | 0.90 | 0.90 |
RPL27 | 0.87 | 0.92 |
Znf32 | 0.86 | 0.86 |
ATP5L | 0.86 | 0.85 |
Fundc2 | 0.86 | 0.86 |
RPS14 | 0.86 | 0.92 |
RPL31 | 0.85 | 0.89 |
SSR4 | 0.85 | 0.91 |
RPS10 | 0.85 | 0.89 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
synm | -0.61 | -0.75 |
ZBTB47 | -0.60 | -0.66 |
RRBP1 | -0.59 | -0.72 |
PLEC1 | -0.56 | -0.61 |
myh9 | -0.56 | -0.58 |
PK4P | -0.55 | -0.65 |
TRIM44 | -0.55 | -0.65 |
sema3g | -0.55 | -0.65 |
EPB41L2 | -0.55 | -0.69 |
myh14 | -0.54 | -0.69 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003735 | 核糖体的结构成分 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006412 | 翻译 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005840 | 核糖体 | IEA | - | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg核糖体 | 88 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SRP依赖性共透明蛋白靶向膜 | 179 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽链伸长 | 153 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 | 176 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感病毒RNA转录和复制 | 169 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 | 176 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Laiho结直肠癌锯齿状DN | 86 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌6小时 | 55 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tien肠益生菌24小时DN | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN | 137 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard对紫外线nhek的反应 | 244 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G1 | 67 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛DN | 88 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小儿小儿所有疗法反应 | 53 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
吴阿尔茨海默氏病DN | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ellwood MYC的目标 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |