基因页：RPS6KA3

概括？
基因 6197
象征 RPS6KA3
同义词 Cls | Hu-3 | ISPK-1 | Mapkapk1b | Mrx19 | RSK | RSK2 | S6K-ALPHA3 | P90-RSK2 | PP90RSK2
描述 核糖体蛋白S6激酶A3
参考 MIM：300075|HGNC：HGNC：10432|ENSEMBL：ENSG00000177189|HPRD：02092|Vega：Otthumg0000000021231
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XP22.2-P22.1
胎儿β -0.28
支持 G2CDB.HUMANNRC
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：1.889
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：1.2387

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS1378559 Chrx 21380266 TC 1.679E-11 基因间 RPS6KA3，CNKSR2 dist = 1095516; dist = 12270


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPL38 0.96 0.93
RPL27A 0.96 0.96
RPL30 0.96 0.95
RPL23 0.95 0.95
RPL35A 0.95 0.93
RPL6P10 0.95 0.90
RPS20 0.95 0.93
RPL37A 0.95 0.93
RPS8 0.94 0.93
RPL24 0.94 0.93
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ATP10A -0.61 -0.81
EDN3 -0.58 -0.73
ptprb -0.57 -0.74
BCl2L2 -0.57 -0.78
ABCB1 -0.56 -0.73
synm -0.56 -0.77
MAP3K5 -0.56 -0.73
SLC6A12 -0.56 -0.76
EHD2 -0.56 -0.78
apol1 -0.56 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0000287 镁离子结合 IEA -
去：0004867 丝氨酸型内肽酶抑制剂活性 IEA -
去：0005524 ATP结合 IEA -
去：0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 经验 9770464
去：0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 塔斯 8141249
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007417 中枢神经系统发展 塔斯 大脑（GO期限：6） 10319851
去：0001501 骨骼系统开发 塔斯 8955270
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去：0007243 蛋白激酶级联反应 IEA -
去：0007165 信号转导 塔斯 10436156
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 艾达 18029348
去：0005654 核质 经验 9770464|16626623
去：0005737 细胞质 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg卵母细胞减数分裂 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg mtor信号通路 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg长期增强 70 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MAPK途径 87 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta GPCR途径 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PC12细胞中的ST分化途径 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA B细胞受体复合物 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST ERK1 ERK2 MAPK途径 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG PIP3在心脏肌周期中发出信号 67 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
心肌细胞中的SIG胰岛素受体途径 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B淋巴细胞中的SIG PIP3信号传导 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST磷酸肌醇3激酶途径 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR途径 61 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1下游途径 105 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB途径 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Trif介导的TLR3信号传导 74 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome核事件激酶和转录因子激活 24 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Erk MAPK目标 21 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
跨化学突触的反应组传播 186 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome神经元系统 279 221 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组神经递质受体结合和突触后细胞中的下游传播 137 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NMDA受体在谷氨酸结合和突触后事件上的反应组激活 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Creb通过RAS激活的磷酸化 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组后NMDA受体激活事件 33 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TLR级联反应组MAP激酶激活 50 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome MAPK靶向由MAP激酶介导的核事件 30 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1反应组信号转导 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1的Reactome回收途径 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 77 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 83 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome先天免疫系统 279 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome激活的TLR4信号传导 93 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome收费受体级联 118 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
igarashi atf4靶向dn 90 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
grabarczyk bcl11b目标 81 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向 292 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽马和紫外线辐射受kyng DNA损伤 88 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向 139 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 4432 4438 M8 HSA-LET-7A脑 ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B脑 ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C脑 ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D脑 agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E脑 ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I脑 ugagguaguugugugugugcugu
mir-142-5p 5136 5142 1a HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-15/16/195/424/497 120 126 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-155 312 318 M8 HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 4444 4450 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-181 636 643 1A，M8 HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-183 4462 4468 1a HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-186 496 502 1a HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-190 5184 5190 1a HSA-MIR-190 ugauuauguuugauauauauaggu
HSA-MIR-190 ugauuauguuugauauauauaggu
MiR-200BC/429 588 594 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-203.1 3101 3107 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-204/211 4998 5005 1A，M8 HSA-MIR-204脑 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir-205 4082 4089 1A，M8 HSA-MIR-205 uccuucauucccggagucug
mir-21 4486 4492 M8 HSA-MIR-21脑 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-216 4551 4557 1a HSA-MIR-216 uaaucucagcuggcaacugug
mir-218 43 49 1a HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-224 3972 3978 1a HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
mir-323 5352 5358 M8 HSA-MIR-323脑 gcacauuacggucgaccucu
mir-326 4514 4520 M8 HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-376 799 805 1a HSA-MIR-376A aucauagaaaaauccacgu
HSA-MIR-376B aucauagaaaaauccauguu
mir-381 5408 5414 M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-384 325 331 1a HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
mir-410 5460 5466 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-494 678 684 1a HSA-MIR-494脑 ugaaacauacgggaaaccucuu
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 388 395 1A，M8 HSA-MIR-93脑 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu