概括
基因 6199
象征 RPS6KB2
同义词 kls | p70-beta | p70-beta-1 | p70-beta-2 | s6k-beta2 | s6k2 | srk | srk | stk14b | p70(s6k)-beta | p70s6kb
描述 核糖体蛋白S6激酶B2
参考 MIM:608939|HGNC:HGNC:10437|ENSEMBL:ENSG00000175634|HPRD:10203|Vega:Otthumg00000167673
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13.2
Pascal P值 0.274
Sherlock P值 0.899
胎儿β 0.144
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG11126068 11 67195806 RPS6KB2 2.16e-8 -0.023 7.29e-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1476792 Chr11 67196236 RPS6KB2 6199 0.02 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RPL39 0.96 0.92
RPL36A 0.88 0.76
AC010468.1 0.83 0.90
RPL41 0.79 0.68
RP11-244J10.1 0.78 0.81
RPL37AP8 0.77 0.68
RPL10AP3 0.77 0.85
RP11-392P7.1 0.75 0.79
RPS10L 0.75 0.79
AC073063.1 0.72 0.70
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
mmrn2 -0.42 -0.60
GPR116 -0.40 -0.63
vwf -0.38 -0.58
net1 -0.38 -0.49
AC013356.3 -0.38 -0.50
ACO2 -0.37 -0.60
CSPG4 -0.37 -0.57
MAP4 -0.37 -0.47
瓦斯 -0.37 -0.67
Tek -0.36 -0.52

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg erbb信号通路 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg mtor信号通路 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg tgf beta信号通路 86 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 97 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg急性髓样白血病 60 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MAPK途径 87 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCF套件的Reactome信号传导 78 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome信号传导 90 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EGFR在癌症中的反应组信号传导 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4信号中的Reactome PI3K事件 38 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2信号中的Reactome PI3K事件 44 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PI3K AKT激活 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GAB1信号体 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PDGF的Reactome信号传导 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome下游信号转导 95 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pi 3K级联 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的下游信号传导激活的FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pip3激活Akt信号传导 29 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR的Reactome信号传导 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Sox4靶向DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井与中度DN 110 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应240 HELA 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon 158 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 common 77 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因