基因页:RPS6KB2
概括?
基因 | 6199 |
象征 | RPS6KB2 |
同义词 | kls | p70-beta | p70-beta-1 | p70-beta-2 | s6k-beta2 | s6k2 | srk | srk | stk14b | p70(s6k)-beta | p70s6kb |
描述 | 核糖体蛋白S6激酶B2 |
参考 | MIM:608939|HGNC:HGNC:10437|ENSEMBL:ENSG00000175634|HPRD:10203|Vega:Otthumg00000167673 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q13.2 |
Pascal P值 | 0.274 |
Sherlock P值 | 0.899 |
胎儿β | 0.144 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG11126068 | 11 | 67195806 | RPS6KB2 | 2.16e-8 | -0.023 | 7.29e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1476792 | Chr11 | 67196236 | RPS6KB2 | 6199 | 0.02 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RPS6KB2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RPL39 | 0.96 | 0.92 |
RPL36A | 0.88 | 0.76 |
AC010468.1 | 0.83 | 0.90 |
RPL41 | 0.79 | 0.68 |
RP11-244J10.1 | 0.78 | 0.81 |
RPL37AP8 | 0.77 | 0.68 |
RPL10AP3 | 0.77 | 0.85 |
RP11-392P7.1 | 0.75 | 0.79 |
RPS10L | 0.75 | 0.79 |
AC073063.1 | 0.72 | 0.70 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
mmrn2 | -0.42 | -0.60 |
GPR116 | -0.40 | -0.63 |
vwf | -0.38 | -0.58 |
net1 | -0.38 | -0.49 |
AC013356.3 | -0.38 | -0.50 |
ACO2 | -0.37 | -0.60 |
CSPG4 | -0.37 | -0.57 |
MAP4 | -0.37 | -0.47 |
瓦斯 | -0.37 | -0.67 |
Tek | -0.36 | -0.52 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg erbb信号通路 | 87 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg mtor信号通路 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg tgf beta信号通路 | 86 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg fc伽马r介导的吞噬作用 | 97 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg急性髓样白血病 | 60 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta MAPK途径 | 87 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCF套件的Reactome信号传导 | 78 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2的Reactome信号传导 | 101 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EGFR在癌症中的反应组信号传导 | 109 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4信号中的Reactome PI3K事件 | 38 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2信号中的Reactome PI3K事件 | 44 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 | 137 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PI3K AKT激活 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GAB1信号体 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PDGF的Reactome信号传导 | 122 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome下游信号转导 | 95 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Pi 3K级联 | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome的下游信号传导激活的FGFR | 100 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Pip3激活Akt信号传导 | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR的Reactome信号传导 | 112 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井与中度DN | 110 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应240 HELA | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon | 158 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 common | 77 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |