基因页：RPS10
Summary？
| 基因 | 6204 |
| 象征 | RPS10 |
| 同义词 | DBA9 | S10 |
| Description | 核糖体蛋白S10 |
| Reference | MIM：603632|HGNC：HGNC：10383|ENSEMBL：ENSG00000124614|HPRD：04697|Vega：Otthumg0000000014546 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p21.31 |
| Pascal P值 | 0.388 |
| Sherlock p-value | 0.064 |
| 胎儿β | 0.361 |
| DMG | 1(# studies) |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| GSMA_I | Genome scan meta-analysis | Psr: 0.033 | |
| gsma_iie | Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples) | PSR：0.04433 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | Beta (dis) | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG08961047 | 6 | 34395138 | RPS10 | 9.91E-6 | 0.391 | 0.013 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6907486 | 6 | 34253877 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 139926 | gtex_brain_ba24 |
| RS206942 | 6 | 34255476 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.717E-6 | 0 | 138327 | gtex_brain_ba24 |
| RS206941 | 6 | 34260177 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 133626 | gtex_brain_ba24 |
| RS7765498 | 6 | 34263037 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 130766 | gtex_brain_ba24 |
| RS6924982 | 6 | 34269856 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 123947 | gtex_brain_ba24 |
| RS6930978 | 6 | 34270668 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 123135 | gtex_brain_ba24 |
| RS410340 | 6 | 34271778 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 122025 | gtex_brain_ba24 |
| RS206921 | 6 | 34283355 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.611E-6 | 0 | 110448 | gtex_brain_ba24 |
| rs3798556 | 6 | 34294006 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 99797 | gtex_brain_ba24 |
| RS206936 | 6 | 34302869 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 90934 | gtex_brain_ba24 |
| RS111671909 | 6 | 34313198 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 80605 | gtex_brain_ba24 |
| RS464553 | 6 | 34315079 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 78724 | gtex_brain_ba24 |
| rs458576 | 6 | 34315091 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 78712 | gtex_brain_ba24 |
| RS206924 | 6 | 34339221 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 54582 | gtex_brain_ba24 |
| rs3798560 | 6 | 34343566 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 50237 | gtex_brain_ba24 |
| RS414739 | 6 | 34344653 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 49150 | gtex_brain_ba24 |
| RS206919 | 6 | 34349541 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 44262 | gtex_brain_ba24 |
| RS77016453 | 6 | 34355535 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 38268 | gtex_brain_ba24 |
| RS6912971 | 6 | 34355658 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 38145 | gtex_brain_ba24 |
| rs9368810 | 6 | 34374795 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.371E-7 | 0 | 19008 | gtex_brain_ba24 |
| RS9380433 | 6 | 34377626 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.884e-6 | 0 | 16177 | gtex_brain_ba24 |
| RS6924482 | 6 | 34387216 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.621E-6 | 0 | 6587 | gtex_brain_ba24 |
| RS2006833 | 6 | 34389143 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.615E-6 | 0 | 4660 | gtex_brain_ba24 |
| RS1811968 | 6 | 34389181 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 2.583E-6 | 0 | 4622 | gtex_brain_ba24 |
| rs9469779 | 6 | 34393845 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.454E-6 | 0 | -42 | gtex_brain_ba24 |
| RS7757586 | 6 | 34395536 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.337E-6 | 0 | -1733 | gtex_brain_ba24 |
| RS9394214 | 6 | 34397353 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.457E-6 | 0 | -3550 | gtex_brain_ba24 |
| RS3913009 | 6 | 34397848 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.457E-6 | 0 | -4045 | gtex_brain_ba24 |
| RS3913010 | 6 | 34397920 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.457E-6 | 0 | -4117 | gtex_brain_ba24 |
| RS7757900 | 6 | 34398879 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.457E-6 | 0 | -5076 | gtex_brain_ba24 |
| rs9368813 | 6 | 34399814 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.457E-6 | 0 | -6011 | gtex_brain_ba24 |
| RS7773447 | 6 | 34405046 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 9.164E-7 | 0 | -11243 | gtex_brain_ba24 |
| RS9366856 | 6 | 34405715 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.244E-6 | 0 | -11912 | gtex_brain_ba24 |
| RS9394218 | 6 | 34405721 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 1.244E-6 | 0 | -11918 | gtex_brain_ba24 |
| rs9469780 | 6 | 34406801 | RPS10 | ENSG00000124614.9 | 8.403E-7 | 0 | -12998 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Mustn1 | 0.86 | 0.87 |
| FXYD1 | 0.84 | 0.87 |
| ifi27 | 0.84 | 0.88 |
| Metrn | 0.81 | 0.87 |
| HSD17B14 | 0.80 | 0.86 |
| Cox4i2 | 0.79 | 0.82 |
| gimap5 | 0.79 | 0.83 |
| VAMP5 | 0.79 | 0.86 |
| tinagl1 | 0.79 | 0.82 |
| NDUFA4L2 | 0.79 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| rnasen | -0.75 | -0.84 |
| ZNF23 | -0.74 | -0.83 |
| PARG | -0.73 | -0.77 |
| CNOT4 | -0.73 | -0.79 |
| RNF146 | -0.73 | -0.80 |
| heatr5b | -0.73 | -0.80 |
| NFX1 | -0.72 | -0.79 |
| ikbkap | -0.72 | -0.80 |
| MARK3 | -0.72 | -0.81 |
| Scaper | -0.72 | -0.81 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17353931 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006414 | 翻译伸长 | 经验 | 15189156 | |
| Cellular component | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO:0005829 | 细胞质 | 经验 | 12588972 | |
| GO:0005840 | 核糖体 | IEA | - | |
| GO:0005840 | 核糖体 | nas | 7772601 | |
| 去：0005737 | cytoplasm | IEA | - | |
| GO：0022627 | 胞质小核糖体亚基 | 艾达 | 8706699|15883184 |