概括
基因 6206
象征 RPS12
同义词 S12
描述 核糖体蛋白S12
参考 MIM:603660|HGNC:HGNC:10385|HPRD:04714|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 6Q23.2
Pascal P值 0.319
Sherlock P值 0.923
胎儿β 0.628
DMG 1(#研究)
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24658452 6 133134754 RPS12 1.392E-4 -0.368 0.031 DMG:Wockner_2014
CG23932593 6 133135524 RPS12; SNORD101 1.528E-4 -0.267 0.032 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ST5 0.81 0.81
PDGFRB 0.81 0.84
LRIG1 0.79 0.80
SLC12A4 0.78 0.74
MCC 0.78 0.77
FAT1 0.75 0.76
rin2 0.74 0.73
NFATC1 0.74 0.69
inppl1 0.73 0.78
timp3 0.73 0.74
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NDUFAF2 -0.39 -0.49
PSMA6 -0.39 -0.53
Znf32 -0.39 -0.50
C20ORF7 -0.39 -0.46
PPP2R3C -0.39 -0.50
PFDN4 -0.38 -0.52
TMEM126A -0.37 -0.46
USMG5 -0.37 -0.49
RPL31 -0.37 -0.51
Hint1 -0.37 -0.43

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg核糖体 88 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome翻译 222 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
三元复合物的反应组形成,随后是43S复合物 74 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SRP依赖性共通晶蛋白靶向膜 179 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
盖结合复合物和EIF的结合后,mRNA的反应组激活,然后与43S结合 84 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽链伸长 153 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 176 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感病毒RNA转录和复制 169 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 176 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨型性白血病DN 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG DN 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI甲状腺癌簇3 28 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX8 PPARG融合的LUI目标 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病DN 121 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bystroem与IL5 UP相关 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM胃癌化学敏感性 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江式下丘脑老化 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1目标 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌与Epcam Up 53 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
因宗乳腺干细胞向上 146 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman vincristine抗性B全部DN 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman vincristine抗性所有DN 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因