基因页:RPS12
概括?
基因 | 6206 |
象征 | RPS12 |
同义词 | S12 |
描述 | 核糖体蛋白S12 |
参考 | MIM:603660|HGNC:HGNC:10385|HPRD:04714| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 6Q23.2 |
Pascal P值 | 0.319 |
Sherlock P值 | 0.923 |
胎儿β | 0.628 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24658452 | 6 | 133134754 | RPS12 | 1.392E-4 | -0.368 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
CG23932593 | 6 | 133135524 | RPS12; SNORD101 | 1.528E-4 | -0.267 | 0.032 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RPS12_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ST5 | 0.81 | 0.81 |
PDGFRB | 0.81 | 0.84 |
LRIG1 | 0.79 | 0.80 |
SLC12A4 | 0.78 | 0.74 |
MCC | 0.78 | 0.77 |
FAT1 | 0.75 | 0.76 |
rin2 | 0.74 | 0.73 |
NFATC1 | 0.74 | 0.69 |
inppl1 | 0.73 | 0.78 |
timp3 | 0.73 | 0.74 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NDUFAF2 | -0.39 | -0.49 |
PSMA6 | -0.39 | -0.53 |
Znf32 | -0.39 | -0.50 |
C20ORF7 | -0.39 | -0.46 |
PPP2R3C | -0.39 | -0.50 |
PFDN4 | -0.38 | -0.52 |
TMEM126A | -0.37 | -0.46 |
USMG5 | -0.37 | -0.49 |
RPL31 | -0.37 | -0.51 |
Hint1 | -0.37 | -0.43 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg核糖体 | 88 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
三元复合物的反应组形成,随后是43S复合物 | 74 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SRP依赖性共通晶蛋白靶向膜 | 179 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
盖结合复合物和EIF的结合后,mRNA的反应组激活,然后与43S结合 | 84 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽链伸长 | 153 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 | 176 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感病毒RNA转录和复制 | 169 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 | 176 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨型性白血病DN | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇3 DN | 229 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG DN | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LUI甲状腺癌簇3 | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAX8 PPARG融合的LUI目标 | 34 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病DN | 121 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bystroem与IL5 UP相关 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM胃癌化学敏感性 | 103 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江式下丘脑老化 | 47 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌与Epcam Up | 53 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
因宗乳腺干细胞向上 | 146 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman vincristine抗性B全部DN | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman vincristine抗性所有DN | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |