基因页:RPS15
概括?
基因 | 6209 |
象征 | RPS15 |
同义词 | 钻机| S15 |
描述 | 核糖体蛋白S15 |
参考 | MIM:180535|HGNC:HGNC:10388|ENSEMBL:ENSG00000115268|HPRD:01613|Vega:Otthumg00000140099 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.3 |
Pascal P值 | 0.037 |
Sherlock P值 | 0.957 |
胎儿β | 0.273 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15408407 | 19 | 1438438 | RPS15 | -0.036 | 0.41 | DMG:Nishioka_2013 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RPS15_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
dbndd2 | 0.93 | 0.93 |
apod | 0.93 | 0.92 |
CYP27A1 | 0.92 | 0.94 |
马尔 | 0.92 | 0.93 |
PLLP | 0.92 | 0.92 |
PLA2G16 | 0.91 | 0.95 |
sema3b | 0.91 | 0.88 |
9月4日 | 0.91 | 0.89 |
S1PR5 | 0.90 | 0.90 |
杂志 | 0.90 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
nkiras2 | -0.63 | -0.70 |
CRMP1 | -0.61 | -0.70 |
KIAA1949 | -0.61 | -0.68 |
tubb2b | -0.60 | -0.71 |
ZBTB8A | -0.60 | -0.69 |
HN1 | -0.60 | -0.71 |
ZNF821 | -0.60 | -0.69 |
STMN1 | -0.60 | -0.71 |
PCDHB18 | -0.60 | -0.69 |
STMN2 | -0.60 | -0.70 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg核糖体 | 88 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
三元复合物的反应组形成,随后是43S复合物 | 74 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SRP依赖性共透明蛋白靶向膜 | 179 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
盖结合复合物和EIF的结合后,mRNA的反应组激活,然后与43S结合 | 84 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽链伸长 | 153 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 | 176 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感病毒RNA转录和复制 | 169 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 | 176 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨型性白血病DN | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tong与PTTG1互动 | 57 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
安倍的内耳 | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
营地结肠癌复制号码 | 92 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHNG多发性骨髓瘤过度 | 52 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉中的罗马胰岛素靶标 | 442 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙雷帕霉素敏感基因 | 39 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
boudoukha由IGF2BP2绑定 | 111 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |