基因页:RPS15A
概括?
基因 | 6210 |
象征 | RPS15A |
同义词 | S15A |
描述 | 核糖体蛋白S15A |
参考 | MIM:603674|HGNC:HGNC:10389|ENSEMBL:ENSG00000134419|HPRD:04723|Vega:Otthumg00000131365 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p |
Pascal P值 | 0.228 |
Sherlock P值 | 0.866 |
胎儿β | 0.525 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG17228833 | 16 | 18812558 | RPS15A | 0.003 | 11.777 | DMG:Vaneijk_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6586487 | CHR1 | 18339747 | RPS15A | 6210 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RPS15A_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003723 | RNA结合 | nas | 9582194 | |
去:0003735 | 核糖体的结构成分 | 艾达 | 15883184 | |
去:0003735 | 核糖体的结构成分 | nas | 9582194 | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 14667819 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006414 | 翻译伸长 | 经验 | 15189156 | |
去:0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | 艾达 | 15108328 | |
去:0009615 | 对病毒的反应 | 艾达 | 15108328 | |
GO:0045787 | 细胞周期的正调控 | 艾达 | 15108328 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 12588972 | |
去:0005840 | 核糖体 | IEA | - | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 15108328 | |
GO:0022627 | 胞质小核糖体亚基 | 艾达 | 15883184 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg核糖体 | 88 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
三元复合物的反应组形成,随后是43S复合物 | 74 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SRP依赖性共透明蛋白靶向膜 | 179 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
盖结合复合物和EIF的结合后,mRNA的反应组激活,然后与43S结合 | 84 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽链伸长 | 153 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 | 176 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感生命周期 | 203 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome流感病毒RNA转录和复制 | 169 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 | 176 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borczuk恶性间皮瘤 | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 | 170 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Myc放大靶向 | 201 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bystroem与IL5 UP相关 | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vietor ifrd1目标 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman vincristine抗性B全部DN | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman vincristine抗性所有DN | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |