概括
基因 6210
象征 RPS15A
同义词 S15A
描述 核糖体蛋白S15A
参考 MIM:603674|HGNC:HGNC:10389|ENSEMBL:ENSG00000134419|HPRD:04723|Vega:Otthumg00000131365
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p
Pascal P值 0.228
Sherlock P值 0.866
胎儿β 0.525
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG17228833 16 18812558 RPS15A 0.003 11.777 DMG:Vaneijk_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6586487 CHR1 18339747 RPS15A 6210 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003723 RNA结合 nas 9582194
去:0003735 核糖体的结构成分 艾达 15883184
去:0003735 核糖体的结构成分 nas 9582194
去:0005515 蛋白质结合 IPI 14667819
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006414 翻译伸长 经验 15189156
去:0008284 细胞增殖的阳性调节 艾达 15108328
去:0009615 对病毒的反应 艾达 15108328
GO:0045787 细胞周期的正调控 艾达 15108328
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 12588972
去:0005840 核糖体 IEA -
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005737 细胞质 艾达 15108328
GO:0022627 胞质小核糖体亚基 艾达 15883184

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg核糖体 88 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome翻译 222 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
三元复合物的反应组形成,随后是43S复合物 74 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SRP依赖性共透明蛋白靶向膜 179 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
盖结合复合物和EIF的结合后,mRNA的反应组激活,然后与43S结合 84 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽链伸长 153 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 176 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感生命周期 203 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome流感病毒RNA转录和复制 169 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胡说八道介导的衰减由外显子连接络合物增强 176 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶标C向上 170 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化中等程度与不良 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bystroem与IL5 UP相关 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vietor ifrd1目标 23 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李最近的胸腺移民 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman vincristine抗性B全部DN 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman vincristine抗性所有DN 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因