基因页:RS1
概括?
基因 | 6247 |
象征 | RS1 |
同义词 | RS | XLRS1 |
描述 | 视网膜1 |
参考 | MIM:300839|HGNC:HGNC:10457|ENSEMBL:ENSG00000102104|HPRD:02426|Vega:Otthumg00000021216 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XP22.13 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RS1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
S100A8 | 0.96 | 0.88 |
S100A12 | 0.85 | 0.73 |
bcl2a1 | 0.78 | 0.58 |
vnn2 | 0.72 | 0.53 |
RNase2 | 0.71 | 0.43 |
莱兹 | 0.70 | 0.63 |
MMP9 | 0.68 | 0.42 |
C1QB | 0.67 | 0.44 |
FPR1 | 0.65 | 0.39 |
Elane | 0.65 | 0.44 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ankrd11 | -0.41 | -0.45 |
mprip | -0.40 | -0.50 |
HNRNPUL2 | -0.38 | -0.54 |
Golga2 | -0.37 | -0.44 |
BOD1L | -0.37 | -0.49 |
myo18a | -0.37 | -0.53 |
myh10 | -0.37 | -0.50 |
MDN1 | -0.37 | -0.45 |
HERC1 | -0.37 | -0.61 |
SPTBN2 | -0.36 | -0.52 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Browne HCMV感染48小时DN | 504 | 323 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |