基因页:夹子1
概括?
基因 | 6249 |
象征 | 夹子1 |
同义词 | 剪辑|剪辑-170 |夹子170 | cyln1 | rsn |
描述 | 包含接头蛋白1的帽盖域1 |
参考 | MIM:179838|HGNC:HGNC:10461|Ensembl:ENSG00000130779|HPRD:01568|Vega:Otthumg00000168922 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 12Q24.3 |
Pascal P值 | 1.928E-5 |
胎儿β | -0.104 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03603505 | 12 | 122839920 | 夹子1 | 4.415E-4 | 0.416 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | 夹子1 | 6249 | 7.424e-7 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | 夹子1 | 6249 | 0.02 | 反式 | ||
RS6741060 | CHR2 | 217169088 | 夹子1 | 6249 | 0.05 | 反式 | ||
RS1563943 | CHR8 | 28145648 | 夹子1 | 6249 | 0.17 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | 夹子1 | 6249 | 1.285E-5 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ifitm2 | 0.77 | 0.77 |
rarres3 | 0.75 | 0.69 |
TIMP1 | 0.74 | 0.78 |
ifitm3 | 0.73 | 0.75 |
PSMB8 | 0.72 | 0.72 |
ftl | 0.72 | 0.54 |
暴利 | 0.71 | 0.67 |
C1QB | 0.71 | 0.62 |
PLSCR1 | 0.70 | 0.64 |
HSD17B8 | 0.70 | 0.55 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HNRNPUL2 | -0.50 | -0.53 |
myo18a | -0.47 | -0.49 |
DDX42 | -0.46 | -0.50 |
SAFB | -0.46 | -0.55 |
SAFB2 | -0.46 | -0.50 |
SPTAN1 | -0.46 | -0.52 |
urg4 | -0.46 | -0.52 |
Arih1 | -0.45 | -0.54 |
zmynd8 | -0.45 | -0.53 |
KDM5C | -0.45 | -0.52 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID MTOR 4 Pathway | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID LIS1途径 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞周期有丝分裂 | 325 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome有丝分裂M M G1相 | 172 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA复制 | 192 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组有丝分裂起点 | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王攀登目标DN | 186 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tang衰老TP53靶向 | 33 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 | 382 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Okumura炎症反应LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C5的反应 | 46 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat的反应24小时 | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma dn | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C | 47 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌肉DN中的罗马胰岛素靶标 | 204 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SYED雌二醇反应 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |