基因页：RTN2
概括？
| 基因 | 6253 |
| 象征 | RTN2 |
| 同义词 | nsp2 | nspl1 | nspli | spg12 |
| 描述 | 网状2 |
| 参考 | MIM：603183|HGNC：HGNC：10468|ENSEMBL：ENSG00000125744|HPRD：04421|Vega：Otthumg00000182123 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19q13.32 |
| Pascal P值 | 0.648 |
| Sherlock P值 | 0.448 |
| 胎儿β | 1.257 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG16158874 | 19 | 46095562 | RTN2 | 5.167E-4 | 6.485 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10510403 | CHR3 | 11066669 | RTN2 | 6253 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Slpi | 0.61 | 0.11 |
| S100A8 | 0.55 | 0.34 |
| S100A9 | 0.53 | 0.28 |
| MT1M | 0.52 | -0.04 |
| MT1A | 0.50 | 0.04 |
| bcl2a1 | 0.47 | 0.21 |
| GPR183 | 0.47 | -0.10 |
| RGS1 | 0.46 | 0.09 |
| TNFRSF6B | 0.45 | 0.39 |
| C1QB | 0.44 | -0.10 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| hexim1 | -0.24 | -0.37 |
| Rab21 | -0.23 | -0.32 |
| TECPR2 | -0.23 | -0.31 |
| rilpl1 | -0.23 | -0.34 |
| FAM98A | -0.22 | -0.35 |
| otud7a | -0.22 | -0.38 |
| VPS13D | -0.22 | -0.28 |
| dst | -0.22 | -0.26 |
| TRIM44 | -0.22 | -0.36 |
| Utrn | -0.22 | -0.37 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chebotaev gr目标dn | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭雷帕霉素的反应 | 203 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙槽横纹肌肉瘤 | 98 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein Pons标记 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巴索毛毛细胞白血病DN | 80 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Izadpanah干细胞脂肪与骨DN | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌良好生存A5 | 70 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇0的时间反应0 | 76 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |