基因页：RYR1
概括？
| 基因 | 6261 |
| 象征 | RYR1 |
| 同义词 | CCO | MHS | MHS1 | PPP1R137 | RYDR | RYR | RYR | RYR-1 | SKRR |
| 描述 | ryanodine受体1 |
| 参考 | MIM：180901|HGNC：HGNC：10483|ENSEMBL：ENSG00000196218|HPRD：01618|Vega：Otthumg00000182403 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19q13.2 |
| Pascal P值 | 0.032 |
| Sherlock P值 | 0.081 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 细胞内信号转导 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0024 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6461405 | CHR7 | 19255956 | RYR1 | 6261 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005245 | 电压门控钙通道活性 | IEA | - | |
| 去：0005216 | 离子通道活动 | IEA | - | |
| 去：0005219 | ryanonodine敏感钙释放通道活性 | IEA | - | |
| GO：0015278 | 钙释放通道活性 | 塔斯 | 9030597 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006816 | 钙离子传输 | 塔斯 | 7511586 | |
| 去：0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
| 去：0006936 | 肌肉收缩 | 塔斯 | 9030597 | |
| 去：0006874 | 细胞钙离子稳态 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005790 | 滑面内质网 | 塔斯 | 2298749 | |
| 去：0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 11206130 | |
| 去：0005938 | 细胞皮质 | 艾达 | 11206130 | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 11206130 | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 2298749 | |
| GO：0014802 | 末端蓄积 | ISS | 1374404 | |
| GO：0030315 | T管 | IEA | - | |
| 去：0030314 | 连接膜络合物 | IEA | - | |
| GO：0031674 | 我乐队 | 艾达 | 11206130 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| St Myocyte广告路径 | 27 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Darwiche Papilloma风险高 | 147 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌 | 146 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Caffarel对THC 24小时3 DN的响应 | 13 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Haslinger B Cll具有17p13删除 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙槽横纹肌肉瘤 | 98 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kuninger IGF1与PDGFB的目标 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 雄鹿癌俯卧反应E2 | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肺部疾病的乳腺癌复发 | 21 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HO肝癌血管侵袭 | 13 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tsutsumi fbxw8目标 | 9 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 35 | 42 | 1A，M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-22 | 85 | 91 | M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |