基因页：bdnf

概括？
基因 627
象征 bdnf
同义词 anon2 | buln2
描述 脑衍生的神经营养因子
参考 MIM：113505|HGNC：HGNC：1033|ENSEMBL：ENSG00000176697|HPRD：00214|Vega：Otthumg00000178797
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P13
Pascal P值 0.002
Sherlock P值 0.855
胎儿β -1.443
DMG 1（＃研究）
主持人 伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 神经营养蛋白信号传导
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症的关键字相同：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字：10

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG10558494 11 27721280 bdnf 1.68e-8 -0.011 6.13e-6 DMG：JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6474972 0 bdnf 627 0.19 反式
RS12452652 CHR17 72235560 bdnf 627 0.09 反式
RS11030023 11 27505351 bdnf ENSG00000176697.14 4.073E-6 0.03 238254 gtex_brain_putamen_basal
RS10835187 11 27505677 bdnf ENSG00000176697.14 1.53E-6 0.03 237928 gtex_brain_putamen_basal
RS112806008 11 27506369 bdnf ENSG00000176697.14 3.968e-6 0.03 237236 gtex_brain_putamen_basal
RS10767644 11 27520671 bdnf ENSG00000176697.14 2.664E-6 0.03 222934 gtex_brain_putamen_basal
RS11030036 11 27525124 bdnf ENSG00000176697.14 2.798E-6 0.03 218481 gtex_brain_putamen_basal
RS12362567 11 27526645 bdnf ENSG00000176697.14 3.622E-6 0.03 216960 gtex_brain_putamen_basal
RS3763965 11 27528987 bdnf ENSG00000176697.14 2.647E-6 0.03 214618 gtex_brain_putamen_basal
RS67924215 11 27533660 bdnf ENSG00000176697.14 2.63E-6 0.03 209945 gtex_brain_putamen_basal
RS10835189 11 27541995 bdnf ENSG00000176697.14 3.628E-6 0.03 201610 gtex_brain_putamen_basal
RS11030042 11 27542328 bdnf ENSG00000176697.14 3.628E-6 0.03 201277 gtex_brain_putamen_basal
RS4528277 11 27565446 bdnf ENSG00000176697.14 3.62E-6 0.03 178159 gtex_brain_putamen_basal
RS11603350 11 27567246 bdnf ENSG00000176697.14 3.628E-6 0.03 176359 gtex_brain_putamen_basal
RS901926 11 27570553 bdnf ENSG00000176697.14 3.628E-6 0.03 173052 gtex_brain_putamen_basal
RS1304101 11 27571594 bdnf ENSG00000176697.14 3.628E-6 0.03 172011 gtex_brain_putamen_basal
RS10835193 11 27572337 bdnf ENSG00000176697.14 3.974E-6 0.03 171268 gtex_brain_putamen_basal
RS11030048 11 27582949 bdnf ENSG00000176697.14 3.628E-6 0.03 160656 gtex_brain_putamen_basal
RS11030052 11 27591812 bdnf ENSG00000176697.14 3.63E-6 0.03 151793 gtex_brain_putamen_basal
RS1387145 11 27600158 bdnf ENSG00000176697.14 3.635E-6 0.03 143447 gtex_brain_putamen_basal
RS10835196 11 27601335 bdnf ENSG00000176697.14 3.637E-6 0.03 142270 gtex_brain_putamen_basal
RS12786828 11 27602642 bdnf ENSG00000176697.14 3.638E-6 0.03 140963 gtex_brain_putamen_basal
RS2029364 11 27605728 bdnf ENSG00000176697.14 3.637E-6 0.03 137877 gtex_brain_putamen_basal
RS2029363 11 27606044 bdnf ENSG00000176697.14 3.642E-6 0.03 137561 gtex_brain_putamen_basal
RS2029362 11 27606133 bdnf ENSG00000176697.14 3.642E-6 0.03 137472 gtex_brain_putamen_basal
RS1948186 11 27610574 bdnf ENSG00000176697.14 3.66E-6 0.03 133031 gtex_brain_putamen_basal
RS11030058 11 27616499 bdnf ENSG00000176697.14 4.021E-6 0.03 127106 gtex_brain_putamen_basal
RS11030059 11 27616617 bdnf ENSG00000176697.14 3.974E-6 0.03 126988 gtex_brain_putamen_basal
RS10835199 11 27617034 bdnf ENSG00000176697.14 4.112E-6 0.03 126571 gtex_brain_putamen_basal
RS10835200 11 27617074 bdnf ENSG00000176697.14 4.114E-6 0.03 126531 gtex_brain_putamen_basal
RS11030060 11 27617566 bdnf ENSG00000176697.14 3.968e-6 0.03 126039 gtex_brain_putamen_basal
RS11030062 11 27617626 bdnf ENSG00000176697.14 3.998E-6 0.03 125979 gtex_brain_putamen_basal
RS11030064 11 27618016 bdnf ENSG00000176697.14 4.227E-6 0.03 125589 gtex_brain_putamen_basal
RS11030065 11 27618108 bdnf ENSG00000176697.14 4.232E-6 0.03 125497 gtex_brain_putamen_basal
RS10835202 11 27618555 bdnf ENSG00000176697.14 4.243E-6 0.03 125050 gtex_brain_putamen_basal
RS7937150 11 27620360 bdnf ENSG00000176697.14 4.236E-6 0.03 123245 gtex_brain_putamen_basal
RS7937485 11 27620473 bdnf ENSG00000176697.14 4.236E-6 0.03 123132 gtex_brain_putamen_basal
RS12798439 11 27621960 bdnf ENSG00000176697.14 4.236E-6 0.03 121645 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0008083 生长因子活性 IEA -
去：0008083 生长因子活性 塔斯 2236018
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007412 轴突目标识别 IEA Axon（GO期限：13） -
去：0007411 轴突指导 IEA Axon（GO期限：13） -
去：0007406 神经细胞增殖的阴性调节 IEA 神经发生（GO期限：10） -
去：0008038 神经元识别 IEA 神经元（GO期限：4） -
GO：0014047 谷氨酸分泌 IEA 谷氨酸，神经递质（GO期限：7） -
GO：0048167 突触可塑性的调节 IEA 突触（GO期限：8） -
GO：0042490 机械感受器的分化 IEA 神经元（GO期限：9） -
去：0045666 神经元分化的阳性调节 IEA 神经元（GO期限：10） -
GO：0043524 神经元细胞凋亡的阴性调节 IEA 神经元（GO期限：9） -
GO：0016358 树突开发 IEA 神经突，树突（GO期限：11） -
去：0001657 输尿管芽开发 IEA -
去：0007631 喂养行为 IEA -
去：0007611 学习或记忆 IEA -
去：0006916 抗凋亡 IEA -
GO：0042493 对药物的反应 IEA -
GO：0042596 恐惧反应 IEA -
GO：0021675 神经发育 IEA -
GO：0019222 代谢过程的调节 IEA -
去：0046668 视网膜细胞编程细胞死亡的调节 IEA -
GO：0048839 内耳的发展 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -
GO：0016023 细胞质膜结合的囊泡 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Huntingtons病 185 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SHP2途径 58 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid ajdiss 2Pathway 48 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR途径 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径 62 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wilcox对孕酮DN的反应 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌基础与间充质DN 50 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1靶向 17 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ingram SHH目标 127 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应120 HELA 69 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF DN的响应 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康（Kang）因tert而永生 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马后产后 63 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weston Vegfa目标6小时 59 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时DN 56 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Delta FOSB目标2WK 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿·维加法（Weston Vegfa）目标12小时 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿Vegfa目标 108 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成8 86 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D2 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向 100 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李小脑老化 84 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
结肠癌DN中甲基化的甲基化 28 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mishra癌相关的成纤维细胞DN 24 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN 435 289 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常老化DN 225 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasini suz12靶向DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Winzen通过KHSRP退化 100 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir1靶向 53 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir30目标 116 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 220 226 M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-10 65 72 1A，M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-103/107 299 305 M8 HSA-MIR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-15/16/195/424/497 300 306 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-155 2797 2803 1a HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-182 252 258 M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-191 393 399 M8 HSA-MIR-191脑 caacggaaucccaaaagcagcu
mir-210 196 202 1a HSA-MIR-210 cugugcgugugugacagcggcuga
mir-30-5p 397 403 1a HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-365 2796 2802 1a HSA-MIR-365 uaaugccccuaaaaaauccuuau
mir-381 11 17 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-382 199 206 1A，M8 HSA-MIR-382脑 Gaaguuucgugguggauucg
mir-409-3p 389 395 M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-410 2768 2774 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-495 552 558 M8 HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-496 2727 2734 1A，M8 HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc