Gene Page:S100A6

概括?
GeneID 6277
Symbol S100A6
Synonyms 2A9|5B10|CABP|CACY|PRA
描述 S100 calcium binding protein A6
参考 MIM:114110|HGNC:HGNC:10496|Ensembl：ENSG00000197956|HPRD:00237|Vega:OTTHUMG00000013549
Gene type protein-coding
Map location 1q21
Sherlock P值 0.19
Fetal beta -2.731
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set 描述 Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统搜索PubMed的基因co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(All samples) Psr: 0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs6747194 chr2 26742755 S100A6 6277 0.18 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
GBF1 0.90 0.90
AP3D1 0.89 0.87
EIF4G1 0.89 0.85
机舱1 0.88 0.86
ube2o 0.88 0.86
HERC2 0.88 0.88
GNAO1 0.88 0.83
TM9SF4 0.87 0.85
EIF4G3 0.87 0.85
DNAJC11 0.87 0.80
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.21 -0.79 -0.77
AF347015.31 -0.78 -0.74
MT-CO2 -0.76 -0.72
higd1b -0.75 -0.71
C1orf54 -0.75 -0.80
GNG11 -0.73 -0.74
IFI27 -0.71 -0.65
VAMP5 -0.71 -0.69
MT-CYB -0.70 -0.65
AF347015.8 -0.70 -0.67

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0048154 S100 beta binding 新闻学会 astrocyte (GO term level: 4) 10913138
GO:0005509 钙离子结合 NAS 12577318
去：0048306 钙依赖性蛋白结合 IDA 10913138
GO:0008270 zinc ion binding IEA -
去：0008083 growth factor activity IEA -
GO:0042803 protein homodimerization activity IDA 10913138
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007409 axonogenesis NAS neuron, axon, neurite (GO term level: 12) 12152788
GO:0007165 signal transduction 塔斯 16130169
GO:0007049 细胞周期 IEA -
去：0008283 细胞增殖 IEA -
GO:0048146 positive regulation of fibroblast proliferation NAS 12577318
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0001726 荷叶边 IDA 10913138
GO:0005634 核 IDA 10913138
GO:0005635 nuclear envelope NAS 12577318
GO:0005737 细胞质 IDA 10913138
GO:0005737 细胞质 塔斯 16130169

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
LIU PROSTATE CANCER DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOEBEKE LYMPHOID STEM CELL DN 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 UP 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG UP 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAMUNYOKOLI OVARIAN CANCER LMP UP 265 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOZGIT ESR1 TARGETS DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis乳腺癌进展DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LANDIS ERBB2 BREAST TUMORS 324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS BASAL 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAMOTO OPN TARGETS CLUSTER 7 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOHANKUMAR TLX1 TARGETS DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数量大与微小 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIANG HEMATOPOIESIS STEM CELL NUMBER SMALL VS HUGE DN 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WILLIAMS ESR2 TARGETS DN 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛克伍德在肺癌中放大 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUH COEXPRESSED WITH ID1 AND ID2 UP 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED WELL VS POORLY DN 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN TUMOR DIFFERENTIATED MODERATELY VS POORLY UP 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN METASTASIS DN 261 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU CELL MIGRATION 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STARK PREFRONTAL CORTEX 22Q11 DELETION DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB TARGETS 1 UP 118 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU CREBBP TARGETS UP 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGLESIAS E2F TARGETS UP 151 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUNO HEMATOPOIESIS 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIMBULAN PARP1 TARGETS UP 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 7 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEEN RESPONSE TO ROSIGLITAZONE DN 106 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HARRIS BRAIN CANCER PROGENITORS 44 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marson Foxp3核心直接目标 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER SILENCED BY METHYLATION UP 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FUJII YBX1 TARGETS UP 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE WNT3A TARGETS DN 97 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG TUMOR INVASIVENESS UP 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA D DN 78 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan晚分化基因上升 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WOO LIVER CANCER RECURRENCE UP 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3 TARGETS UP 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FONTAINE FOLLICULAR THYROID ADENOMA DN 68 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FONTAINE PAPILLARY THYROID CARCINOMA UP 66 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liang造血细胞数QTL 17 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 13 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI INDUCED T TO NATURAL KILLER UP 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS CONFLUENT 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU EZH2 TARGETS UP 295 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEMAGALHAES AGING UP 55 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP B 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM GLIS2 TARGETS UP 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN 315 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1 TARGETS UP 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 4 110 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOUDOUKHA BOUND BY IGF2BP2 111 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA SECRETED FACTORS 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA MATRISOME ASSOCIATED 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA MATRISOME 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因