Gene Page:S100A11
概括?
| 基因 | 6282 |
| Symbol | S100A11 |
| Synonyms | HEL-S-43|MLN70|S100C |
| Description | S100 calcium binding protein A11 |
| Reference | MIM:603114|HGNC:HGNC:10488|Ensembl:ENSG00000163191|HPRD:04385|Vega:OTTHUMG00000013069 |
| Gene type | protein-coding |
| Map location | 1q21 |
| Fetal beta | -0.717 |
| eGene | Myers' cis & trans |
数据源中的基因
| Gene set name | Method of gene set | Description | Info |
|---|---|---|---|
| CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS | |
| PMID:cooccur | High-throughput literature-search | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
| GSMA_I | Genome scan meta-analysis | Psr: 0.0235 | |
| GSMA_IIA | Genome scan meta-analysis (All samples) | Psr: 0.00814 | |
| Literature | High-throughput literature-search | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | Click to show details |
| GO_Annotation | Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations | 与神经相关的关键字的命中：1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
eQTL annotation
eQTL annotation| SNP ID | Chromosome | Position | eGene | Gene Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS distance | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs17013080 | chr1 | 208862652 | S100A11 | 6282 | 0.14 | trans | ||
| rs4844714 | chr1 | 208874118 | S100A11 | 6282 | 0 | trans | ||
| rs10494904 | chr1 | 208883320 | S100A11 | 6282 | 0.03 | trans | ||
| rs12097986 | chr1 | 208883360 | S100A11 | 6282 | 0.03 | trans | ||
| RS3846885 | chr6 | 37678984 | S100A11 | 6282 | 0.13 | trans | ||
| rs7754123 | chr6 | 132667231 | S100A11 | 6282 | 8.001E-5 | trans | ||
| rs1812421 | chr8 | 122074407 | S100A11 | 6282 | 0.06 | trans | ||
| rs17076272 | chr13 | 22726361 | S100A11 | 6282 | 0.09 | trans | ||
| rs17076274 | chr13 | 22726381 | S100A11 | 6282 | 0.09 | trans | ||
| rs16959803 | chr13 | 88488982 | S100A11 | 6282 | 0.17 | trans | ||
| rs16982879 | chrX | 92924110 | S100A11 | 6282 | 0.1 | trans | ||
| rs7879274 | chrX | 145592957 | S100A11 | 6282 | 0.14 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
No co-expressed genes in brain regions
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0048154 | S100 beta binding | 新闻学会 | astrocyte (GO term level: 4) | 10913138 |
| GO:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| GO:0048306 | calcium-dependent protein binding | IDA | 10913138 | |
| GO:0042803 | protein homodimerization activity | IDA | 10913138 | |
| 生物过程 | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0007165 | signal transduction | TAS | 16130169 | |
| GO:0008285 | negative regulation of cell proliferation | TAS | 10851017 | |
| GO:0008156 | negative regulation of DNA replication | TAS | 10851017 | |
| Cellular component | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0001726 | 荷叶边 | IDA | 10913138 | |
| GO:0005634 | nucleus | IDA | 10913138 | |
| GO:0005737 | 细胞质 | IDA | 10913138 | |
| GO:0005737 | 细胞质 | TAS | 16130169 |
Section V. Pathway annotation
| Pathway name | Pathway size | # SZGR 2.0 genes in pathway | Info |
|---|---|---|---|
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONKEN UVEAL MELANOMA UP | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BORCZUK MALIGNANT MESOTHELIOMA UP | 305 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BASAKI YBX1 TARGETS UP | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WANG CLIM2 TARGETS UP | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VECCHI GASTRIC CANCER EARLY UP | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE NEURAL CREST STEM CELL UP | 146 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HUMMEL BURKITTS LYMPHOMA DN | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SABATES COLORECTAL ADENOMA UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PROVENZANI METASTASIS DN | 136 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE UP | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DELYS THYROID CANCER UP | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WANG ESOPHAGUS CANCER VS NORMAL DN | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DARWICHE皮肤余脉R PROMOTER DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DARWICHE PAPILLOMA RISK LOW UP | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DARWICHE PAPILLOMA RISK HIGH UP | 147 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| darwiche鳞状细胞癌 | 146 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCHLOSSER SERUM RESPONSE UP | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BORLAK LIVER CANCER EGF UP | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIANG HEMATOPOIESIS STEM CELL NUMBER LARGE VS TINY DN | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIANG HEMATOPOIESIS STEM CELL NUMBER SMALL VS HUGE UP | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN UP | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LOCKWOOD AMPLIFIED IN LUNG CANCER | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RICKMAN METASTASIS DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FRIDMAN SENESCENCE UP | 77 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH PROLIFERATION | 147 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAUFFMANN DNA REPLICATION GENES | 147 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEART HDAC PROLIFERATION CLUSTER DN | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CROMER METASTASIS DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IGLESIAS E2F TARGETS UP | 151 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEEN RESPONSE TO ROSIGLITAZONE DN | 106 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kayo卡路里限制肌肉 | 95 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR UP | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HELLER HDAC TARGETS DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRADE COLON CANCER UP | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GOLDRATH ANTIGEN RESPONSE | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ichiba移植与宿主疾病35D UP | 131 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG TLX TARGETS 36HR UP | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG TLX TARGETS 60HR UP | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG TLX TARGETS UP | 108 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHEN METABOLIC SYNDROM NETWORK | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G5 DN | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MEISSNER NPC HCP WITH H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Liang造血细胞数QTL | 17 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 12 | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LI INDUCED T TO NATURAL KILLER UP | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VERHAAK GLIOBLASTOMA MESENCHYMAL | 216 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ACOSTA PROLIFERATION INDEPENDENT MYC TARGETS DN | 116 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PILON KLF1 TARGETS DN | 1972 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JOHNSTONE PARVB TARGETS 2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA SECRETED FACTORS | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA MATRISOME ASSOCIATED | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA MATRISOME | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |