基因页：SBF1
概括？
| 基因 | 6305 |
| 象征 | SBF1 |
| 同义词 | cmt4b3 | dennd7a | mtmr5 |
| 描述 | 设定结合因子1 |
| 参考 | MIM：603560|HGNC：HGNC：10542|ENSEMBL：ENSG00000100241|HPRD：06788|Vega：Otthumg00000150204 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 22q13.33 |
| Pascal P值 | 0.036 |
| Sherlock P值 | 0.065 |
| 胎儿β | -0.933 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG27544191 | 22 | 50913719 | SBF1 | 3.34e-4 | -0.415 | 0.041 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLA | 0.82 | 0.75 |
| AP000926.2 | 0.82 | 0.72 |
| POU3F2 | 0.80 | 0.71 |
| MEX3B | 0.80 | 0.73 |
| CSRP2 | 0.79 | 0.63 |
| ZNF167 | 0.79 | 0.74 |
| mllt3 | 0.78 | 0.75 |
| PGBD2 | 0.78 | 0.71 |
| TTC28 | 0.78 | 0.76 |
| ZSCAN2 | 0.78 | 0.74 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AIFM3 | -0.56 | -0.65 |
| C5orf53 | -0.56 | -0.63 |
| LHPP | -0.55 | -0.57 |
| HLA-F | -0.55 | -0.62 |
| LDHD | -0.55 | -0.59 |
| FBXO2 | -0.55 | -0.59 |
| pth1r | -0.55 | -0.62 |
| aldoc | -0.55 | -0.58 |
| TSC22D4 | -0.55 | -0.65 |
| ACOT13 | -0.54 | -0.59 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 通过CD40 UP的Hollmann凋亡 | 201 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭葡萄糖剥夺 | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wong IFNA2电阻DN | 34 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 整合素信号传导 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk男性繁殖Sertoli | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染1小时DN | 222 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |