基因页：atxn2

概括？
基因 6311
象征 atxn2
同义词 asl13 | atx2 | sca2 | tnrc13
描述 ataxin 2
参考 MIM：601517|HGNC：HGNC：10555|Ensembl：ENSG00000204842|HPRD：03307|Vega：Otthumg00000133475
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q24.1
Pascal P值 0.308
Sherlock P值 0.143
胎儿β 0.077
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历：Phewas 全球整个关联研究（PHEWAS） 157个与精神分裂症相关的SNP 0
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.02

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6128541 CHR20 57917688 atxn2 6311 0.1 反式
RS1964825 CHR20 57919515 atxn2 6311 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003723 RNA结合 nas 10814712
去：0008022 蛋白C末端结合 IPI 15663938
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006417 翻译调节 nas 16835262
GO：0016070 RNA代谢过程 nas 15663938
去：0008219 细胞死亡 IEA -
GO：0034063 压力颗粒组件 小鬼 17392519
GO：0033962 细胞质mRNA加工体组装 小鬼 17392519
去：0050658 RNA运输 nas 10814712
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005794 高尔基体 艾达 12812977|17097639
去：0005802 反式高尔基网络 艾达 10814712
去：0005844 多层 艾达 16835262
去：0005737 细胞质 艾达 10814712|17392519
GO：0010494 压力颗粒 艾达 17392519
GO：0048471 细胞质的核周区 艾达 17097639

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
ENK UV响应角质形成细胞DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno岩石信号不是通过Rhoa DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制目标 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Takao对UVB辐射DN的响应 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期 125 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞SCP2 QTL Trans 25 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移 221 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IRS1和IRS2的GUO目标 98 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 106 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-145 265 272 1A，M8 HSA-MIR-145 guccaguuucccaggaaucccuu
mir-15/16/195/424/497 346 353 1A，M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-204/211 516 522 1a HSA-MIR-204脑 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir-218 64 70 M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-433-3p 302 308 1a HSA-MIR-433脑 aucaugauggggcuccucggugu
mir-503 347 353 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag