基因页:CCL1
概括?
基因 | 6346 |
象征 | CCL1 |
同义词 | I-309 | P500 | Scya1 | Sise | TCA3 |
描述 | C-C基序趋化因子配体1 |
参考 | MIM:182281|HGNC:HGNC:10609|ENSEMBL:ENSG00000108702|HPRD:01654|Vega:Otthumg00000132888 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q12 |
Pascal P值 | 0.837 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CCL1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
VAT1 | 0.88 | 0.87 |
GPRIN2 | 0.88 | 0.86 |
DOK4 | 0.87 | 0.90 |
limk2 | 0.87 | 0.76 |
EFNA2 | 0.87 | 0.83 |
在一个 | 0.86 | 0.88 |
ST8SIA2 | 0.86 | 0.87 |
SLC37A1 | 0.86 | 0.89 |
AC110814.1 | 0.85 | 0.89 |
fblim1 | 0.85 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.62 | -0.77 |
C5orf53 | -0.62 | -0.76 |
aldoc | -0.59 | -0.69 |
AF347015.27 | -0.58 | -0.86 |
AF347015.31 | -0.58 | -0.86 |
SPARCL1 | -0.58 | -0.66 |
FBXO2 | -0.58 | -0.62 |
CA4 | -0.58 | -0.68 |
hepn1 | -0.57 | -0.73 |
TSC22D4 | -0.57 | -0.75 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Okumura炎症反应LPS | 183 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1的Verhaak AML突变 | 183 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee老化新皮层DN | 80 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Worschech肿瘤排斥 | 56 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaurnier PSMD4目标 | 73 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟A | 67 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集2 | 29 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集3 | 33 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤 | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号cor dn | 36 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn | 88 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr dn | 37 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇1 DN | 48 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 dn | 38 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |