概括
基因 6346
象征 CCL1
同义词 I-309 | P500 | Scya1 | Sise | TCA3
描述 C-C基序趋化因子配体1
参考 MIM:182281|HGNC:HGNC:10609|ENSEMBL:ENSG00000108702|HPRD:01654|Vega:Otthumg00000132888
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q12
Pascal P值 0.837

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
VAT1 0.88 0.87
GPRIN2 0.88 0.86
DOK4 0.87 0.90
limk2 0.87 0.76
EFNA2 0.87 0.83
在一个 0.86 0.88
ST8SIA2 0.86 0.87
SLC37A1 0.86 0.89
AC110814.1 0.85 0.89
fblim1 0.85 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.62 -0.77
C5orf53 -0.62 -0.76
aldoc -0.59 -0.69
AF347015.27 -0.58 -0.86
AF347015.31 -0.58 -0.86
SPARCL1 -0.58 -0.66
FBXO2 -0.58 -0.62
CA4 -0.58 -0.68
hepn1 -0.57 -0.73
TSC22D4 -0.57 -0.75

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG趋化因子信号传导途径 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Okumura炎症反应LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化新皮层DN 80 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
safford t淋巴细胞厌食 87 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Worschech肿瘤排斥 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaurnier PSMD4目标 73 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟A 67 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集2 29 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集3 33 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤 36 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号cor dn 36 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度cor dn 88 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr dn 37 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇1 DN 48 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 dn 38 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 151 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因