基因页面:CCL22
总结吗?
GeneID | 6367年 |
象征 | CCL22 |
同义词 | a - 152 - e5.1 | ABCD-1 | DC / B-CK | MDC | SCYA22 | STCP-1 |
描述 | 主题趋化因子配体22 |
参考 | MIM: 602957|HGNC: HGNC: 10621|运用:ENSG00000102962|HPRD: 04263|织女:OTTHUMG00000133454 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16个问题 |
帕斯卡假定值 | 0.156 |
胎儿β | 0.382 |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs9977484 | chr21 | 42040486 | CCL22 | 6367年 | 0.16 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CCL22_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
COL8A1 | 0.40 | 0.29 |
TBX18 | 0.40 | 0.33 |
ITIH2 | 0.38 | 0.23 |
SPTA1 | 0.38 | 0.28 |
PCOLCE | 0.37 | 0.26 |
COL5A1 | 0.37 | 0.31 |
WISP1 | 0.37 | 0.25 |
PROCR | 0.37 | 0.33 |
SERPIND1 | 0.36 | 0.27 |
COL3A1 | 0.36 | 0.35 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.9 | -0.17 | -0.20 |
SLC25A18 | -0.17 | -0.17 |
PTH1R | -0.17 | -0.16 |
ROM1 | -0.17 | -0.19 |
CST3 | -0.17 | -0.18 |
NTSR2 | -0.17 | -0.14 |
MRPL41 | -0.17 | -0.20 |
APOE | -0.16 | -0.14 |
ZNF385A | -0.16 | -0.14 |
MT-CO2 | -0.16 | -0.19 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体的相互作用 | 267年 | 161年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG趋化因子信号通路 | 190年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME肽配体受体有约束力 | 188年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME类A1受体等视紫红质 | 305年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME趋化因子受体结合趋化因子 | 57 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GPCR配体结合 | 408年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人 | 579年 | 346年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应表皮DN | 508年 | 354年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
兰斯乳腺癌16问若以桑不光要拷贝数 | 63年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DIRMEIER LMP1回应晚了 | 57 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 | 398年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LENAOUR树突状细胞成熟 | 114年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
低音部CD40信号了 | 101年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
佐藤在胰腺癌1被甲基化 | 419年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
巨噬细胞培养宽容DN | 409年 | 268年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WORSCHECH肿瘤排斥了 | 56 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YAUCH刺猬信号旁分泌 | 149年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LINDSTEDT树突状细胞成熟D | 68年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA CSF2RB和IL4 | 338年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA应对HGF | 418年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RUTELLA HGF VS CSF2RB和IL4 DN | 245年 | 150年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KUROZUMI应对ONCOCYTIC病毒 | 44 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KUROZUMI反应和循环RGD ONCOCYTIC病毒 | 21 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WIERENGA STAT5A目标了 | 217年 | 131年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
WIERENGA STAT5A目标GROUP2 | 60 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄宗泽过敏原诱导TH2相关模块 | 151年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA分泌的因素 | 344年 | 197年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA MATRISOME相关 | 753年 | 411年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
NABA MATRISOME | 1028年 | 559年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |