基因页：SDF2
概括？
| 基因 | 6388 |
| 象征 | SDF2 |
| 同义词 | - |
| 描述 | 基质细胞衍生因子2 |
| 参考 | MIM：602934|HGNC：HGNC：10675|ENSEMBL：ENSG00000132581|HPRD：04243|Vega：Otthumg00000132681 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q11.2 |
| Pascal P值 | 0.189 |
| Sherlock P值 | 0.167 |
| 胎儿β | 0.085 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG22463517 | 17 | 26988906 | SDF2 | 2.55e-10 | -0.011 | 6.32E-7 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG10824491 | 17 | 26989063 | SDF2 | 1.34E-8 | -0.006 | 5.33e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CD44 | 0.82 | 0.73 |
| ECM2 | 0.79 | 0.73 |
| AK7 | 0.74 | 0.64 |
| Anxa1 | 0.73 | 0.63 |
| CCDC151 | 0.72 | 0.65 |
| AC079354.2 | 0.71 | 0.60 |
| dnah9 | 0.71 | 0.67 |
| mylk3 | 0.71 | 0.48 |
| EFHC2 | 0.70 | 0.61 |
| rsph1 | 0.70 | 0.77 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLA | -0.40 | -0.42 |
| ISLR2 | -0.39 | -0.45 |
| Dact1 | -0.39 | -0.43 |
| klhl1 | -0.38 | -0.44 |
| mpped1 | -0.38 | -0.48 |
| SSBP2 | -0.38 | -0.47 |
| TMEM108 | -0.38 | -0.41 |
| Scube1 | -0.38 | -0.49 |
| SATB2 | -0.38 | -0.45 |
| vash2 | -0.37 | -0.44 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rashi对电离辐射1的响应1 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lenaour树突状细胞成熟DN | 128 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu Crebbp目标DN | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Maekawa ATF2目标 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| boudoukha由IGF2BP2绑定 | 111 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |