基因页面:PIEZO2
总结吗?
| GeneID | 63895年 |
| 象征 | PIEZO2 |
| 同义词 | C18orf30 | C18orf58 | DA3 | DA5 | FAM38B | FAM38B2 | HsT748 | HsT771 | MWKS |
| 描述 | 压电式mechanosensitive离子通道组件2 |
| 参考 | MIM: 613629|HGNC: HGNC: 26270|运用:ENSG00000154864|HPRD: 07636|织女:OTTHUMG00000178507 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 18 p11.22 |
| 帕斯卡假定值 | 0.319 |
| 夏洛克假定值 | 0.017 |
| 胎儿β | -1.727 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 认为:McCarthy_2014 | 全外显子组测序分析 | 全外显子组测序的57个三人小组与零星或家族性精神分裂症。 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| PIEZO2 | chr18 | 10691256 | NM_022068 | p.S2326N | 错义SNV | C | D | 精神分裂症 | 认为:McCarthy_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs12144179 | chr1 | 7288506 | FAM38B | 63895年 | 0.14 | 反式 | ||
| rs6725530 | chr2 | 40530640 | FAM38B | 63895年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs1526289 | chr2 | 150606532 | FAM38B | 63895年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs6448932 | chr4 | 12595798 | FAM38B | 63895年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs7898310 | chr10 | 2819459 | FAM38B | 63895年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs2293743 | chr11 | 298223年 | FAM38B | 63895年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs6632306 | chrX | 35590460 | FAM38B | 63895年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs16999998 | chrX | 128224551 | FAM38B | 63895年 | 0.16 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 周炎症反应费马 | 544年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 格雷厄姆CML分裂和正常的分割 | 13 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 格雷厄姆CML分裂和正常的静止 | 181年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过小道HAMAI细胞凋亡 | 584年 | 356年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 帕蒂尔肝癌 | 747年 | 453年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NPM1 ALCALAY AML的本地化 | 140年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VERHAAK AML和NPM1突变 | 183年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里奇尤因肉瘤祖DN | 191年 | 123年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乳腺癌萧述三腔的B | 172年 | 109年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VALK AML集群3 | 33 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VALK AML集群6 | 33 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VALK AML FLT3 ITD | 40 | 22 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝胚细胞瘤了 | 207年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RATTENBACHER受CELF1 | 467年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO FGFR1在前列腺癌模型的目标 | 289年 | 184年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |