基因页面:SEC14L1
总结吗?
| GeneID | 6397年 |
| 象征 | SEC14L1 |
| 同义词 | PRELID4A | SEC14L |
| 描述 | SEC14与脂质结合1 |
| 参考 | MIM: 601504|HGNC: HGNC: 10698|运用:ENSG00000129657|HPRD: 03295|织女:OTTHUMG00000177311 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 17 q25.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.288 |
| 夏洛克假定值 | 0.611 |
| 胎儿β | -0.798 |
| DMG | 3(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
| 支持 | CompositeSet 达内尔FMRP目标 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 7 |
| DMG: Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括172复制与精神分裂症之间的联系论文认定。 | 7 |
| DMG: vanEijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括432个不同甲基化CpG网站对应391精神分裂症患者之间独特的成绩单(n = 260)和对照组(n = 250)的影响。 | 7 |
| 表达式 | 荟萃分析的基因表达 | P值:1.526 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg11186858 | 17 | 75096382 | SEC14L1 | 4.93 e-6 | 0.011 | 0.029 | DMG: Montano_2016 |
| cg11597902 | 17 | 75096239 | SEC14L1 | 1.49 e-5 | 0.01 | 0.054 | DMG: Montano_2016 |
| cg20610950 | 17 | 75096202 | SEC14L1 | 7.93 e-5 | 0.012 | 0.112 | DMG: Montano_2016 |
| cg26547236 | 17 | 75136326 | SEC14L1 | 1.4 e-8 | -0.017 | 5.44 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
| cg04452095 | 17 | 75315868 | SEC14L1 | 7.817的军医 | -4.44 | DMG: vanEijk_2014 | |
| cg03330678 | 17 | 75316233 | SEC14L1 | 5.18 e-5 | -4.793 | DMG: vanEijk_2014 | |
| cg03330678 | 17 | 75316233 | SEC14L1 | 4.57 e-5 | -5.707 | DMG: vanEijk_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs11695174 | chr2 | 9788314 | SEC14L1 | 6397年 | 0.2 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ACIN1 | 0.93 | 0.92 |
| LAS1L | 0.92 | 0.92 |
| RBM6 | 0.92 | 0.93 |
| ANKZF1 | 0.92 | 0.92 |
| RBM5 | 0.92 | 0.92 |
| TRPV1 | 0.92 | 0.93 |
| CLK2 | 0.91 | 0.92 |
| MICAL1 | 0.91 | 0.91 |
| FNBP4 | 0.91 | 0.91 |
| ANO8 | 0.90 | 0.90 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.70 | -0.79 |
| B2M | -0.67 | -0.73 |
| AF347015.27 | -0.67 | -0.76 |
| IFI27 | -0.66 | -0.74 |
| MT-CO2 | -0.66 | -0.76 |
| COPZ2 | -0.65 | -0.71 |
| C5orf53 | -0.64 | -0.65 |
| MT-CYB | -0.63 | -0.72 |
| HIGD1B | -0.63 | -0.74 |
| PSMB9 | -0.63 | -0.70 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005488 | 绑定 | 助教 | 8697811 | |
| 去:0005215 | 运输活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006810 | 运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005794 | 高尔基体 | 助教 | 8697811 | |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016020 | 膜 | 助教 | 8697811 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| TURASHVILI乳腺导管癌与导管正常的DN | 198年 | 110年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 威尔科克斯对孕激素 | 152年 | 90年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应生活 | 485年 | 293年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应生活的DN | 384年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DITTMER PTHLH目标了 | 112年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ODONNELL TFRC目标了 | 456年 | 228年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TIEN肠道益生菌6小时DN | 167年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| HAHTOLA蕈样了 | 19 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHIARADONNA肿瘤转化喀斯特DN | 142年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHIARADONNA肿瘤转化CDC25 DN | 153年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数 | 181年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN NIPP1目标 | 848年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC DN的目标 | 366年 | 238年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| THEILGAARD中性粒细胞在皮肤伤口DN | 225年 | 163年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦克朗可卡因奖励5 d | 79年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 击倒老化肌肉DN | 123年 | 76年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡DN | 287年 | 208年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马森FOXP3如果绑定 | 1229年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯坦ESRRA DN的目标 | 105年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里奇尤因肉瘤祖 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织DN | 274年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOQUEST干细胞DN | 216年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SHEDDEN肺癌生存A12好 | 317年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 斯坦ESRRA目标 | 535年 | 325年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACOSTA扩散独立MYC目标DN | 116年 | 74年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FEVR CTNNB1目标了 | 682年 | 433年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过KDM3A KRIEG缺氧不 | 770年 | 480年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 促进DN KDM1A目标 | 211年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| let-7/98 | 453年 | 459年 | 1 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
| hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
| hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
| hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
| hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
| hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
| hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
| hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
| hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
| mir - 190 | 419年 | 425年 | 1 | hsa - mir - 190 | UGAUAUGUUUGAUAUAUUAGGU |
| mir - 208 | 383年 | 389年 | 1 | hsa - mir - 208 | AUAAGACGAGCAAAAAGCUUGU |
| mir - 218 | 178年 | 184年 | m8 | hsa - mir - 218大脑 | UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU |
| miR-23 | 516年 | 523年 | 1、m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| mir - 323 | 516年 | 522年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 499 | 383年 | 389年 | 1 | hsa - mir - 499 | UUAAGACUUGCAGUGAUGUUUAA |