基因页：Neurod6

概括？
基因 63974
象征 Neurod6
同义词 AtoH2 | MATH2 | MATH-2 | NEX1M | NEX1 | BHLHA2
描述 神经元分化6
参考 MIM：611513|HGNC：HGNC：13804|ENSEMBL：ENSG00000164600|HPRD：11387|Vega：Otthumg0000000022865
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p14.3
Pascal P值 0.024
Sherlock P值 0.285
胎儿β 2.04
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10777641 CHR12 95252883 Neurod6 63974 0.14 反式
RS12229276 CHR12 104204770 Neurod6 63974 0.19 反式
RS17806577 CHR12 104548282 Neurod6 63974 0.16 反式
RS175740 Chrx 135690651 Neurod6 63974 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003677 DNA结合 IEA -
GO：0030528 转录调节器活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007399 神经系统的发展 IEA 神经突（GO期限：5） -
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
去：0030154 细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向 100 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 208 215 1A，M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-153 521 528 1A，M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-27 209 215 M8 HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-30-5p 101 107 M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-376c 145 152 1A，M8 HSA-MIR-376C aacauagaggaaauuccacg
mir-448 522 528 1a HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-486 705 711 M8 HSA-MIR-486 uccuguacugagcugcccccgag
mir-495 711 718 1A，M8 HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 673 679 M8 HSA-MIR-93脑 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu