基因页面:PRDM16
总结吗?
GeneID | 63976年 |
象征 | PRDM16 |
同义词 | CMD1LL | LVNC8 | MEL1 | PFM13 |
描述 | 公关领域16 |
参考 | MIM: 605557|HGNC: HGNC: 14000|运用:ENSG00000142611|HPRD: 16122|织女:OTTHUMG00000000581 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 1 p36.32 |
帕斯卡假定值 | 0.034 |
胎儿β | 0.97 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg05790380 | 1 | 3144209 | PRDM16 | 5.4 e-5 | 0.376 | 0.022 | DMG: Wockner_2014 |
cg14216672 | 1 | 3265923 | PRDM16 | 4.128的军医 | 0.596 | 0.044 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PRDM16_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
VECCHI胃癌早期DN | 367年 | 220年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
JAATINEN造血干细胞 | 316年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
沈SMARCA2 DN的目标 | 357年 | 212年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃长期造血干细胞 | 302年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YAUCH刺猬信号旁分泌DN | 264年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GRESHOCK癌症拷贝数 | 323年 | 240年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 | 349年 | 234年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 | 898年 | 516年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
RATTENBACHER受CELF1 | 467年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |