基因页面:CDH23
总结吗?
| GeneID | 64072年 |
| 象征 | CDH23 |
| 同义词 | CDHR23 | USH1D |
| 描述 | cadherin-related 23 |
| 参考 | MIM: 605516|HGNC: HGNC: 13733|运用:ENSG00000107736|HPRD: 05699|织女:OTTHUMG00000019347 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 10 q22.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.244 |
| 夏洛克假定值 | 0.789 |
| 胎儿β | -1.583 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
| 支持 | 细胞粘附和TRANSSYNAPTIC信号 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg12568633 | 10 | 73533407 | CDH23; C10orf54 | 3.36 e-5 | -0.305 | 0.019 | DMG: Wockner_2014 |
| cg09810750 | 10 | 73533449 | CDH23 | 4.41 e-8 | -0.016 | 1.21 e-5 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs16829545 | chr2 | 151977407 | CDH23 | 64072年 | 3.913 e-5 | 反式 | ||
| rs6741728 | chr2 | 153268745 | CDH23 | 64072年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs7584986 | chr2 | 184111432 | CDH23 | 64072年 | 0.02 | 反式 | ||
| rs1396222 | chr4 | 173279496 | CDH23 | 64072年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs335993 | chr4 | 173321789 | CDH23 | 64072年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs10491487 | chr5 | 80323367 | CDH23 | 64072年 | 3.997的军医 | 反式 | ||
| rs17057688 | chr6 | 130033232 | CDH23 | 64072年 | 0 | 反式 | ||
| rs6996695 | chr8 | 77540580 | CDH23 | 64072年 | 0.02 | 反式 | ||
| rs11139334 | chr9 | 84209393 | CDH23 | 64072年 | 3.532 e-5 | 反式 | ||
| snp_a - 4267673 | 0 | CDH23 | 64072年 | 0.01 | 反式 | |||
| rs3762058 | chr9 | 116842332 | CDH23 | 64072年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs946861 | chr10 | 21281250 | CDH23 | 64072年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs7111644 | chr11 | 93300259 | CDH23 | 64072年 | 0.15 | 反式 | ||
| rs9989228 | chr14 | 37809252 | CDH23 | 64072年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs16955618 | chr15 | 29937543 | CDH23 | 64072年 | 1.092 e-5 | 反式 | ||
| rs2077735 | chr15 | 58479024 | CDH23 | 64072年 | 0.04 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1目标了 | 566年 | 371年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN脑桥标记 | 89年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTENS受PML RARA融合 | 456年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应了 | 857年 | 456年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |