基因页：SLC39A8

Summary？
基因ID 64116
Symbol SLC39A8
同义词 bigm103 | cdg2n | lzt-hs6 | pp3105 | zip8
描述 Solute Carrier家族39成员8
参考 MIM：608732|HGNC:HGNC:20862|ENSEMBL：ENSG00000138821|HPRD: 12286|织女:OTTHUMG00000131120
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q24
Pascal P值 0.012
胎儿β -0.293
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb.
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p Function 基因 向上/向下距离
RS35518360 CHR4 103146890 在 9.562e-13 intergenic Bank1，SLC39A8 dist = 150921; dist = 25308

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
cg27293549 4 103266755 SLC39A8 3.3E-5 -0.386 0.019 DMG：Wockner_2014
cg19916409 4 103266691 SLC39A8 3.87E-4 -0.178 0.043 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10497672 0 SLC39A8 64116 0.16 反式
RS1578978 CHR8 118196802 SLC39A8 64116 0.09 反式
RS4829359 Chrx 35348569 SLC39A8 64116 0.14 反式
RS5973369 Chrx 35392270 SLC39A8 64116 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
葡萄糖和其他糖的反应组运输胆汁盐和有机酸金属离子和胺化合物 89 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome锌转运蛋白 15 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME METAL ION SLC TRANSPORTERS 22 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoebeke淋巴干细胞DN 86 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
帕帕斯帕斯帕贝多诺斯不稳定的动脉粥样硬化斑块 52 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC1靶向 457 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Jaatinen造血干细胞向上 316 190 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林格伦膀胱癌群集3 329 196 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP 214 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP63目标 355 243 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应DN 712 443 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mohankumar TLX1靶向 414 287 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王HCP前列腺癌 111 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR UP 116 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer Sox9在前列腺开发中的目标 21 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标 775 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onder CDH1目标2 DN 464 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
郭十六进制靶向DN 65 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN 371 218 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kaab心脏中心与心室 249 170 All SZGR 2.0 genes in this pathway
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yegnasubramanian前列腺癌 128 60 All SZGR 2.0 genes in this pathway
斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）的靶向对雌激素的反应 31 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR UP 430 288 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌 973 570 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 104 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
对Salirasib dn的Blum响应 342 220 All SZGR 2.0 genes in this pathway
螺旋吸烟者肺癌 38 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 536 296 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G1 DN 40 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein ESR1目标 85 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein Esrra目标 535 325 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stein雌激素反应不是通过ESRRA 18 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束 1103 714 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄成人组织茎模块 721 492 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇12的时间反应12 79 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hirsch细胞转换签名 242 159 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1靶向衰老 572 352 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR UP 324 193 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向 504 321 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2目标 745 475 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 151 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BOSCO干扰素诱导的抗病毒模块 78 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Durand Stroma S向上 297 194 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ghandhi旁观者辐照 86 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang EGF间隔 105 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway