基因页:fn3k
概括?
基因 | 64122 |
象征 | fn3k |
同义词 | - |
描述 | 果糖3激酶 |
参考 | MIM:608425|HGNC:HGNC:24822|ENSEMBL:ENSG00000167363|HPRD:16336|Vega:Otthumg00000177847 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17q25.3 |
Pascal P值 | 0.446 |
Sherlock P值 | 0.864 |
胎儿β | -0.332 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG27574244 | 17 | 80709357 | fn3k | 1.43E-9 | -0.025 | 1.39E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11650019 | CHR17 | 80750689 | fn3k | 64122 | 5.291E-8 | 顺式 | ||
RS610516 | CHR17 | 80762838 | fn3k | 64122 | 3.059E-8 | 顺式 | ||
RS662669 | CHR17 | 80776042 | fn3k | 64122 | 2.346e-12 | 顺式 | ||
RS603016 | CHR17 | 80778780 | fn3k | 64122 | 1.843e-11 | 顺式 | ||
RS11078015 | CHR17 | 80783008 | fn3k | 64122 | 4.369e-13 | 顺式 | ||
RS7225515 | CHR17 | 80795782 | fn3k | 64122 | 1.273E-6 | 顺式 | ||
RS4986113 | CHR17 | 80796235 | fn3k | 64122 | 1.549E-13 | 顺式 | ||
RS7216324 | CHR17 | 80809464 | fn3k | 64122 | 5.871E-4 | 顺式 | ||
RS9913679 | CHR17 | 80812897 | fn3k | 64122 | 0 | 顺式 | ||
RS7224427 | CHR17 | 80825206 | fn3k | 64122 | 0.02 | 顺式 | ||
RS2292971 | CHR17 | 80863856 | fn3k | 64122 | 0.03 | 顺式 | ||
RS10918646 | CHR1 | 167126035 | fn3k | 64122 | 0.14 | 反式 | ||
RS12091071 | CHR1 | 167132050 | fn3k | 64122 | 0.17 | 反式 | ||
RS4419089 | 0 | fn3k | 64122 | 5.084e-7 | 反式 | |||
RS11650019 | CHR17 | 80750689 | fn3k | 64122 | 1.2e-5 | 反式 | ||
RS610516 | CHR17 | 80762838 | fn3k | 64122 | 7.136E-6 | 反式 | ||
RS662669 | CHR17 | 80776042 | fn3k | 64122 | 5.783E-10 | 反式 | ||
RS603016 | CHR17 | 80778780 | fn3k | 64122 | 4.783E-9 | 反式 | ||
RS11078015 | CHR17 | 80783008 | fn3k | 64122 | 1.058e-10 | 反式 | ||
RS7225515 | CHR17 | 80795782 | fn3k | 64122 | 2.321E-4 | 反式 | ||
RS4986113 | CHR17 | 80796235 | fn3k | 64122 | 3.525e-11 | 反式 | ||
RS7216324 | CHR17 | 80809464 | fn3k | 64122 | 0.05 | 反式 | ||
RS9913679 | CHR17 | 80812897 | fn3k | 64122 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FN3K_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Affar YY1靶向DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向DN | 242 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |