概括
基因 64122
象征 fn3k
同义词 -
描述 果糖3激酶
参考 MIM:608425|HGNC:HGNC:24822|ENSEMBL:ENSG00000167363|HPRD:16336|Vega:Otthumg00000177847
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q25.3
Pascal P值 0.446
Sherlock P值 0.864
胎儿β -0.332
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG27574244 17 80709357 fn3k 1.43E-9 -0.025 1.39E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11650019 CHR17 80750689 fn3k 64122 5.291E-8 顺式
RS610516 CHR17 80762838 fn3k 64122 3.059E-8 顺式
RS662669 CHR17 80776042 fn3k 64122 2.346e-12 顺式
RS603016 CHR17 80778780 fn3k 64122 1.843e-11 顺式
RS11078015 CHR17 80783008 fn3k 64122 4.369e-13 顺式
RS7225515 CHR17 80795782 fn3k 64122 1.273E-6 顺式
RS4986113 CHR17 80796235 fn3k 64122 1.549E-13 顺式
RS7216324 CHR17 80809464 fn3k 64122 5.871E-4 顺式
RS9913679 CHR17 80812897 fn3k 64122 0 顺式
RS7224427 CHR17 80825206 fn3k 64122 0.02 顺式
RS2292971 CHR17 80863856 fn3k 64122 0.03 顺式
RS10918646 CHR1 167126035 fn3k 64122 0.14 反式
RS12091071 CHR1 167132050 fn3k 64122 0.17 反式
RS4419089 0 fn3k 64122 5.084e-7 反式
RS11650019 CHR17 80750689 fn3k 64122 1.2e-5 反式
RS610516 CHR17 80762838 fn3k 64122 7.136E-6 反式
RS662669 CHR17 80776042 fn3k 64122 5.783E-10 反式
RS603016 CHR17 80778780 fn3k 64122 4.783E-9 反式
RS11078015 CHR17 80783008 fn3k 64122 1.058e-10 反式
RS7225515 CHR17 80795782 fn3k 64122 2.321E-4 反式
RS4986113 CHR17 80796235 fn3k 64122 3.525e-11 反式
RS7216324 CHR17 80809464 fn3k 64122 0.05 反式
RS9913679 CHR17 80812897 fn3k 64122 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1靶向DN 234 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因