基因页面:LIN7B
总结吗?
| GeneID | 64130年 |
| 象征 | LIN7B |
| 同义词 | LIN-7B | MALS-2 | MALS2 | VELI2 |
| 描述 | lin-7同族体B,面包屑细胞极性复杂的组件 |
| 参考 | MIM: 612331|HGNC: HGNC: 17788|运用:ENSG00000104863|HPRD: 10040|织女:OTTHUMG00000134288 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 19 q13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.005 |
| 夏洛克假定值 | 0.619 |
| 胎儿β | -1.094 |
| eGene | 皮质 元 |
| 支持 | 蛋白质聚类 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS CompositeSet |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:4 | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.1336 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 16192269 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007269 | 神经递质分泌 | 国际能源机构 | Synap神经元,轴突,5 -羟色胺,多巴胺神经递质,(术语层面:8) | - - - - - - |
| 去:0006887 | 胞外分泌 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0015031 | 蛋白质的运输 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005923 | 紧密连接 | 国际能源机构 | 大脑(词级:10) | - - - - - - |
| 去:0019717 | 突触体 | 国际能源机构 | Synap,大脑(术语层面:7) | - - - - - - |
| 去:0045211 | 突触后膜 | 国际能源机构 | Synap,神经递质(术语层面:5) | - - - - - - |
| 去:0045202 | 突触 | 国际能源机构 | Synap神经元,神经递质,神经胶质(术语层面:2) | - - - - - - |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016323 | 管基底等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030054 | 细胞结 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ENK紫外线反应表皮DN | 508年 | 354年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标G | 238年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李老化小脑DN | 86年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 《图片报》E2F3致癌签名 | 246年 | 153年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里奇尤因肉瘤祖 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOLENAAR CCND1和到的目标 | 67年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 200 bc / 429 | 41 | 47 | m8 | hsa - mir - 200 b | UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC |
| hsa - mir - 200 c | UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG | ||||
| hsa - mir - 429 | UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU | ||||